Cas13d 直系同源物、EsCas13d 和 RspCas13d 对单核苷酸变异的敏感分析,Biotechnology and Bioengineering

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Cas13d 直系同源物、EsCas13d 和 RspCas13d 对单核苷酸变异的敏感分析
Biotechnology and Bioengineering ( IF 3.5 ) Pub Date : 2021-05-08 , DOI: 10.1002/bit.27813
Xin Qiao _{1,

2} , Yanmin Gao _{1,

2} , Jiaojiao Li _{1,

2} , Zhaoguan Wang _{1,

2} , Hongyan Qiao _{1,

2} , Hao Qi _{1,

2}

Affiliation

RNA-guided CRISPR（RNA-targeting clustered regular interspaced short palindromic repeats）效应子 Cas13d 是迄今为止发现的最小的 II 类亚型 VI 蛋白。在这里，两个最近发现的来自真杆菌 (Es) 和瘤胃球菌的Cas13d效应子. (Rsp) 进行了表征并应用于灵敏的核酸检测。我们证明了这两个 Cas13d 直系同源物的特殊目标触发的侧链切割可以提供皮摩尔范围内的快速目标 RNA 检测，然后还表征了 crRNA 和目标 RNA 之间错配的耐受性。最后，将一个额外的单一错配引入 crRNA 以增强两个 Cas13d 直系同源物介导的低变异等位基因分数 0.1% T790M 的检测。总体而言，本研究表明，EsCas13d 和 RspCas13d 都可以稳健地检测携带特殊单核苷酸变异的靶 RNA，具有高特异性和高灵敏度，从而为高效分子诊断提供了新的合格工具箱。

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更新日期：2021-07-16

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