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使用 DMS 和 CMCT 通过化学探测方法研究 RNA 二级结构。
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Pub Date : 2021-01-01 , DOI: 10.1007/978-1-0716-1386-3_18 Fatima Alghoul 1 , Gilbert Eriani 1 , Franck Martin 1
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Pub Date : 2021-01-01 , DOI: 10.1007/978-1-0716-1386-3_18 Fatima Alghoul 1 , Gilbert Eriani 1 , Franck Martin 1
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RNA 折叠成可用于理解各种 RNA 功能的二级结构（Weeks KM. Curr Opin Struct Biol 20(3):295-304, 2010）。化学探测是一种使用化学试剂来表征 RNA 二级结构的方法，该化学试剂专门修饰位于单链区域的 RNA 核苷酸。在我们的协议中，我们使用了硫酸二甲酯 (DMS) 和 Cyclohexyl-3-(2-Morpholinoethyl) Carbodiimide metho-p-Toluene 磺酸盐 (CMCT)，它们都是碱基特异性修饰试剂 (Behm-Ansmant I, et al. J Nucleic酸 2011:408053, 2011)。这些修饰通过使用 5' 荧光标记引物的引物延伸阻滞进行映射。在该协议中，我们展示了一种使用荧光标记寡核苷酸在体外识别 RNA 二级结构的综合方法。为了证明该方法的有效性，
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更新日期：2021-01-01
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