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Cobolt：多模式单细胞测序数据的联合分析
bioRxiv - Bioinformatics Pub Date : 2021-11-10 , DOI: 10.1101/2021.04.03.438329
Boying Gong , Yun Zhou , Elizabeth Purdom
bioRxiv - Bioinformatics Pub Date : 2021-11-10 , DOI: 10.1101/2021.04.03.438329
Boying Gong , Yun Zhou , Elizabeth Purdom
越来越多的单细胞测序平台能够对来自同一细胞的多个组学进行联合分析。我们提出了 Cobolt，这是一种新方法，它不仅允许分析来自联合模态平台的数据，而且为集成在不同模态上测量的多个数据集提供了一个连贯的框架。我们展示了它在基因表达和染色质可及性的多模态数据上的性能，并通过与单细胞 RNA-seq 和 ATAC-seq 数据集联合分析这些多模态数据来说明 Cobolt 的整合能力。
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更新日期：2021-11-13
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