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电生理和转录组学特征揭示了皮质神经元的圆形分类法。
bioRxiv - Neuroscience Pub Date : 2021-03-26 , DOI: 10.1101/2021.03.24.436849 Alejandro Rodríguez-Collado , Cristina Rueda
bioRxiv - Neuroscience Pub Date : 2021-03-26 , DOI: 10.1101/2021.03.24.436849 Alejandro Rodríguez-Collado , Cristina Rueda
对哺乳动物大脑的完全理解需要对组成其各个部分的每个神经元的功能有确切的了解。为实现此目标,应定义一个详尽,准确,可重现且健壮的神经元分类法。本文提出了一种基于转录组特征和新的电生理特征的新的圆形分类法。通过分析来自Allen Cell Types Database的1850多种不同的小鼠视觉皮层神经元的电生理信号,验证了该方法的有效性。该研究在两个不同的水平上进行:神经元及其细胞类型聚集到Cre系中。在神经元水平上,已经用一种有前途的模型提取了电生理特征,该模型已经在神经元动力学中证明了其价值。在Cre Line级别,电生理学和转录组学特征与具有可用遗传信息的细胞类型结合在一起。通过对前两个主成分的简单转换即可显示出具有循环顺序的分类法,从而可以表征不同的Cre线。此外,所提出的方法可以在分类法中找到其他Cre谱系,这些谱系没有可用的转录组学特征。最后,通过机器学习方法验证了分类法,该方法能够区分具有建议的电生理特征的不同神经元类型。所提出的方法可以在分类法中找到其他Cre谱系,这些谱系没有可用的转录组学特征。最后,通过机器学习方法验证了分类法,该方法能够区分具有建议的电生理特征的不同神经元类型。所提出的方法可以在分类法中找到其他Cre谱系,这些谱系没有可用的转录组学特征。最后,通过机器学习方法验证了分类法,该方法能够区分具有建议的电生理特征的不同神经元类型。
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更新日期:2021-03-27
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