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wzb磷酸酶和wzc激酶相互作用的合理靶向抑制了鲍曼不动杆菌中胞外多糖的合成和生物膜的形成
Carbohydrate Research ( IF 2.4 ) Pub Date : 2020-06-01 , DOI: 10.1016/j.carres.2020.108025
Monalisa Tiwari , Shruti Panwar , Akansha Kothidar , Vishvanath Tiwari
Carbohydrate Research ( IF 2.4 ) Pub Date : 2020-06-01 , DOI: 10.1016/j.carres.2020.108025
Monalisa Tiwari , Shruti Panwar , Akansha Kothidar , Vishvanath Tiwari
鲍曼不动杆菌是机会性医院内病原体,并导致高死亡率和发病率。生物膜形成是抗性决定因素之一,其中细胞外多糖(EPS)是必不可少的成分。EPS的合成及其输出受细菌Wza-Wzb-Wzc系统的调节。Wzc表现出自磷酸化蛋白酪氨酸激酶活性,而Wzb是一种蛋白酪氨酸磷酸酶。Wzb介导Wzc的去磷酸化。通过孔蛋白Wza-Wzc复合物出口EPS时需要脱磷酸的Wzc。它表明Wzb与Wzc的相互作用对于EPS的出口至关重要。因此,如果Wzb-Wzc相互作用被抑制,则可能会阻碍EPS的运输并减少生物膜的形成。在这项研究中,我们对Wzb和Wzc蛋白进行了建模,并使用PSVS进行了进一步验证,ProSA,RAMPAGE和PDBsum。建模的蛋白质用于蛋白质-蛋白质对接。使用OPLS_2005力场,通过Schrodinger软件将对接的蛋白质-蛋白质复合物最小化。最小化的Wzb-Wzc复合体的结合位点由Sitemap识别。高通量虚拟筛选基于其在Wzb-Wzc界面上的相互作用,从FDA批准的药物库中鉴定了盐酸Labetalol和4- {1-羟基-2-[(1-甲基-3-苯基丙基)氨基]丙基}苯酚复杂的。使用广义博恩模型和溶剂可及性(MMGBSA)对抑制剂-蛋白质复合物进行了进一步的分子力学分析,以估计结合自由能。铅还用于生成药效团模型并用抗菌支架筛选分子。鉴定出的铅通过鲍曼不动杆菌对EPS量和生物膜形成的影响进行了实验验证。Wzb-Wzc相互作用对于生物膜和EPS的输出至关重要;因此,鉴定出的铅可能有助于调节鲍曼不动杆菌的生物膜形成。
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更新日期:2020-06-01

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