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研究 aspereline 肽的螺旋构象
Chemical Biology & Drug Design ( IF 3.2 ) Pub Date : 2021-02-26 , DOI: 10.1111/cbdd.13834
Eszter Blanár 1 , Balázs Leitgeb 1
Chemical Biology & Drug Design ( IF 3.2 ) Pub Date : 2021-02-26 , DOI: 10.1111/cbdd.13834
Eszter Blanár 1 , Balázs Leitgeb 1
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Asperelines 是短序列 peptaibol 分子，这些由 10 个残基组成的肽是从Trichoderma asperellum中分离出来的。在我们的研究中，通过分子动力学方法对 asperelines 进行了详细的结构表征。对于 aspereline 肽，沿着它们的整个序列研究了各种二级结构元件（即 β 转角和螺旋结构）的出现。从模拟退火计算得出的结果导致观察到，在 asperelines 的情况下，I、III 和 III 型β-转角结构，以及它们的稳定i ← i+3氢键出现。然而，除了不同的 β 转角之外，还检测到更短或更长的螺旋结构。基于分子动力学模拟的结果，可以得出结论，aspereline肽的三维结构可以用螺旋构象（即3 10-和α-螺旋）表征。尽管如此，根据个体分子动力学轨迹，观察到 asperelines 不仅可以采用右手螺旋结构，还可以采用左手螺旋结构。
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更新日期：2021-04-13
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