硫鸟苷转化通过双代谢标记通过 RNA 测序实现 mRNA 寿命评估,Angewandte Chemie

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硫鸟苷转化通过双代谢标记通过 RNA 测序实现 mRNA 寿命评估
Angewandte Chemie Pub Date : 2020-02-28 , DOI: 10.1002/ange.201916272
Catherina Gasser ₁ , Isabel Delazer ₂ , Eva Neuner ₁ , Katharina Pascher ₂ , Karl Brillet ₃ , Sarah Klotz ₁ , Lukas Trixl ₂ , Maximilian Himmelstoß ₁ , Eric Ennifar ₃ , Dietmar Rieder ₄ , Alexandra Lusser ₂ , Ronald Micura ₁

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有关细胞 RNA 种群的时间信息对于理解 RNA 的功能作用至关重要。我们开发了基于肼/NH4 Cl/OsO4 的 6-硫鸟苷 (6sG) 转化为 A'，其中 A' 构成 6-肼基嘌呤衍生物。A' 保留了 Watson-Crick 碱基对模式，并在引物延伸分析和 RNA 测序中被有效地解码为腺苷。由于 6sG 适用于新鲜合成 RNA 的代谢标记，并且由于转化化学与常用代谢标记 4-硫尿苷 (4sU) 到 C 的转化完全兼容，因此双标记设置中两种修饰核苷的组合可实现高RNA衰变的准确测量。这种方法称为 TUC-seq DUAL，

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更新日期：2020-02-28

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