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Kobophen A 抑制宿主 ACE2 受体与 SARS-CoV-2（一种用于阻断 COVID-19 的先导化合物）的刺突 RBD 结构域的结合
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2021-02-12 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.0c03119 Suresh Gangadevi 1 , Vishnu Nayak Badavath 2 , Abhishek Thakur 3 , Na Yin 1 , Steven De Jonghe 4 , Orlando Acevedo 3 , Dirk Jochmans 4 , Pieter Leyssen 4 , Ke Wang 5 , Johan Neyts 4 , Tao Yujie 6 , Galia Blum 2
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2021-02-12 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.0c03119 Suresh Gangadevi 1 , Vishnu Nayak Badavath 2 , Abhishek Thakur 3 , Na Yin 1 , Steven De Jonghe 4 , Orlando Acevedo 3 , Dirk Jochmans 4 , Pieter Leyssen 4 , Ke Wang 5 , Johan Neyts 4 , Tao Yujie 6 , Galia Blum 2
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在寻找 COVID-19 抑制剂时，我们瞄准了人类血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 受体与 SARS-CoV-2 刺突受体结合域 (S1-RBD) 之间的相互作用。对天然化合物库的虚拟筛选将 Kobophen A 确定为潜在的抑制剂。然后发现 Kobophen A在体外可阻断 ACE2 受体和 S1-RBD 之间的相互作用，IC 50为 1.81 ± 0.04 μM，并抑制细胞中的 SARS-CoV-2 病毒感染，EC 50为 71.6 μM。盲对接计算确定了两个潜在的结合位点，分子动力学模拟预测 Kobophen A 与刺突/ACE2 界面和 ACE2 疏水口袋的结合自由能分别为 -19.0 ± 4.3 和 -24.9 ± 6.9 kcal/mol。综上所述，通过对接研究鉴定的 Kobophen A 是第一个通过阻断 S1-RBD 与宿主 ACE2 受体结合来抑制 SARS-CoV-2 与细胞结合的化合物，因此可能作为对抗 COVID-19 的良好先导化合物。
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更新日期：2021-02-25
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