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大分子科学观点一百周年:数据驱动的蛋白质设计
ACS Macro Letters ( IF 5.1 ) Pub Date : 2021-02-08 , DOI: 10.1021/acsmacrolett.0c00885 Andrew L Ferguson 1 , Rama Ranganathan 1, 2, 3
ACS Macro Letters ( IF 5.1 ) Pub Date : 2021-02-08 , DOI: 10.1021/acsmacrolett.0c00885 Andrew L Ferguson 1 , Rama Ranganathan 1, 2, 3
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设计具有所需功能的合成蛋白质是生物分子科学的长期目标,在生化工程、农业、医学和公共卫生等领域具有广泛的应用。理性的从头设计和实验性定向进化取得了显着的成功,但面临着在蛋白质序列空间的巨大“大海捞针”中寻找功能“针”的挑战。健身景观的数据驱动模型提供了蛋白质序列和功能之间的预测图,并且可以前瞻性地识别用于实验测试的功能候选者,从而大大提高这种搜索的效率。本观点回顾了机器学习的应用,特别是作为数据驱动蛋白质工程平台一部分的深度学习。我们强调最近的成功,回顾有前景的计算方法,并展望未来的挑战和机遇。这篇文章是为广大读者撰写的,包括聚合物和蛋白质科学家以及计算机和数据科学家,他们对这个快速发展的领域的最新创新和机遇感兴趣。
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更新日期:2021-03-16
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