与 Ybx1 敲除斑马鱼胚胎发育有关的长链非编码 RNA,FEBS Open Bio

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与 Ybx1 敲除斑马鱼胚胎发育有关的长链非编码 RNA
FEBS Open Bio ( IF 2.8 ) Pub Date : 2020-12-05 , DOI: 10.1002/2211-5463.13057
Chen Huang ₁ , Bo Zhu ₂ , Dongliang Leng ₂ , Wei Ge ₂ , Xiaohua Douglas Zhang ₂

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Y-box 结合蛋白 1 (Ybx1, YB-1)，也称为 Y-box 转录因子，参与多种生物过程 (BPs) 和通路，包括脊椎动物的胚胎发生、繁殖和发育。几种非编码 RNA 调节 Ybx1 信号。然而，长链非编码 RNA (lncRNA) 在胚胎发生中的作用仍不完全清楚。在这里，我们通过对来自ybx1纯合突变斑马鱼第 5 天 (day5_ ybx1 ^-/- ) 和第 5 天野生型斑马鱼的 RNA 测序数据进行系统转录组分析，研究了 lncRNA 可能参与Ybx1介导的脊椎动物发育调控。和6（day5_ ybx1 ^{+ / +}和day6_ ybx1 ^{+ / +}）。我们鉴定了几种受ybx1破坏影响的lncRNA，它们可能靶向还原-氧化相关基因，例如duox（NADPH 氧化酶）和noxo1a（NADPH 氧化酶组织者）。敲除三个选定的 lncRNA 会导致幼虫的形态变形，这意味着这些 lncRNA 参与了斑马鱼胚胎发育。总之，我们的研究为 LncRNA 介导的Ybx1 缺陷斑马鱼幼虫发育的潜在机制提供了新的见解。

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更新日期：2020-12-05

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