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苹果基因功能和基因家族数据库:苹果研究的综合生物信息学数据库
Plant Growth Regulation ( IF 3.5 ) Pub Date : 2013-01-22 , DOI: 10.1007/s10725-013-9787-6
Shizhong Zhang , Guang Hui Chen , Yukun Liu , Hao Chen , Guodong Yang , Xiaowei Yuan , Zesheng Jiang , Huairui Shu

苹果(Malusdomestica)是世界上经济上最重要的水果作物之一,因为它对人类的营养和健康很重要。为了分析不同苹果基因的功能和进化,我们开发了苹果基因功能和基因家族数据库(AppleGFDB),用于收集、存储、整理和整合苹果的功能基因组学信息。AppleGFDB 提供了有关苹果基因的多层信息,包括核苷酸和蛋白质序列、染色体位置、基因结构以及与这些注释相关的任何出版物。为了进一步分析苹果基因的功能基因组数据,AppleGFDB 旨在使用户能够通过一套接口轻松检索信息,包括基因本体、蛋白质域和 InterPro。此外,该数据库提供了分析苹果表达谱和 microRNA 的工具。此外,所有分析和收集的数据都可以从数据库中下载。还可以使用支持全文搜索、BLAST 序列搜索和数据库浏览的便捷 Web 服务器访问该数据库。此外,为了促进苹果研究人员之间的合作,AppleGFDB 以用户交互平台的形式呈现,为用户提供修改苹果基因注释和提交相关基因发表信息的机会。AppleGFDB 可在 http://www.applegene.org 或 http://gfdb.sdau.edu.cn/ 获得。还可以使用支持全文搜索、BLAST 序列搜索和数据库浏览的便捷 Web 服务器访问该数据库。此外,为了促进苹果研究人员之间的合作,AppleGFDB 以用户交互平台的形式呈现,为用户提供修改苹果基因注释和提交相关基因发表信息的机会。AppleGFDB 可在 http://www.applegene.org 或 http://gfdb.sdau.edu.cn/ 获得。还可以使用支持全文搜索、BLAST 序列搜索和数据库浏览的便捷 Web 服务器访问该数据库。此外,为了促进苹果研究人员之间的合作,AppleGFDB 以用户交互平台的形式呈现,为用户提供修改苹果基因注释和提交相关基因发表信息的机会。AppleGFDB 可从 http://www.applegene.org 或 http://gfdb.sdau.edu.cn/ 获得。



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更新日期:2013-01-22
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