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具有完整簇的 NifB 的 X 射线晶体学分析:对氮酶辅因子组装过程中自由基 SAM 依赖性碳化物插入的结构洞察
Angewandte Chemie International Edition ( IF 16.1 ) Pub Date : 2020-10-09 , DOI: 10.1002/anie.202011367
Wonchull Kang 1 , Lee A Rettberg 1 , Martin T Stiebritz 1 , Andrew J Jasniewski 1 , Kazuki Tanifuji 1 , Chi Chung Lee 1 , Markus W Ribbe 1, 2 , Yilin Hu 1
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NifB 是组装固氮酶辅因子的 8Fe 核心所需的基本自由基 SAM 酶。在此,我们报告了没有 (apo Mt NifB) 和 (holo Mt NifB) 完整的三个 [Fe 4 S 4 ] 簇的Methanobacterium thermoautotrophicum NifB的 X 射线晶体结构。apo 和 holo Mt NifB 都包含部分 TIM 桶芯,但与 apo Mt NifB 不同的是,holo MtNifB 在辅因子生物合成中完全组装并胜任。自由基 SAM (RS) 簇由三个 Cys 配位,相邻的 K1 和 K2 簇代表 8Fe 辅因子核心的前体,每个簇由一个 His 和两个 Cys 配位。底物通道的预测,结合 SAM 在全息Mt NifB 中的计算机对接,表明 SAM 在 RS 和 K2 簇之间的结合以及 SAM 进入和 SAM 裂解产物退出的推定路径,从而提供重要的机制见解伴随着辅因子核心形成的自由基SAM依赖的碳化物插入。



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更新日期:2020-10-09
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