果蝇果蝇逆转录转座子具有长末端重复的完整分类（LTR-retrotransposons）已被重组，并且在果蝇和其他节肢动物不同物种的测序基因组中进行了其进化分析。D. melanogaster LTR-逆转录转座子分为三类：吉普赛人（一个，两个或三个开放阅读框（ORF）），鸦片（一个ORF）和BEL（一个ORF）。吉普赛人小组分为三个子小组。具有三个ORF及其衍生物的反转录转座子-逆转录病毒代表亚组I的代表性不足，这两个ENF丢失了环境基因（ORF3）。具有两个ORF的反转录转座子不能代表II组，具有一个ORF的反转录转座子却不能代表III组。吉普赛族LTR-逆转座子同源物的比较分析表明，亚组I和II仅在鳞翅目和双翅目的基因组中存在。几乎在所有节肢动物基因组中都发现了具有一个和两个ORF的LTR逆转座子的吉普赛族。D. melanogaster吉普赛人的大多数家庭LTR-逆转座子组在果蝇其他物种的基因组中具有紧密的同源物。逆转座子序列的同一性程度与果蝇种之间的相关程度相关，表明逆转座子的垂直传播。已经发现了一些可移动元件水平转移的明显案例，包括没有env基因的反转录转座子。反转录转座子的基因不同ORF的同源GAG和ENV -具备被发现。gag基因Grp（CG5680）的基因同系物正在纯化选择中，因此在果蝇基因组中具有重要的功能。



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