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用于探索蛋白质结构域的蛋白质表面打印机。
Journal of Chemical Information and Modeling ( IF 5.6 ) Pub Date : 2020-08-26 , DOI: 10.1021/acs.jcim.0c00582 Yang Li 1 , Baofu Qiao 2 , Monica Olvera de la Cruz 1, 2, 3
Journal of Chemical Information and Modeling ( IF 5.6 ) Pub Date : 2020-08-26 , DOI: 10.1021/acs.jcim.0c00582 Yang Li 1 , Baofu Qiao 2 , Monica Olvera de la Cruz 1, 2, 3
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蛋白质表面对于确定蛋白质功能至关重要。在此，构建了蛋白质表面打印机（PSP）程序，该程序在定量蛋白质表面域时执行多种功能。使用两种蛋白质PETase和细胞色素P450来验证程序是否使用程序和力场的不同组合来支持原子模拟。对SARS-CoV-2和SARS-CoV的刺突蛋白和人类细胞受体ACE2的结构分析进行了案例研究。尽管两种刺突蛋白的表面结构域高度相似，但它们的受体结合结构域（RBD）和O-连接的聚糖结构域在结构上不同。SARS-CoV-2的O-连接聚糖结构域带正电，可促进与带负电的人类细胞的结合。
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更新日期：2020-10-26
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