基因表达响应于多种环境刺激而改变，以调节多种细胞功能。在信使RNA（mRNA）的帮助下，基因被表达为其功能性产物。因此，测量细胞中mRNA的水平对于理解细胞功能很重要。随着下一代测序（NGS）的发展，已经通过转录组测序阐明了细胞mRNA的丰度。但是，几项研究发现，翻译调节诱导的mRNA丰度与蛋白质水平之间存在差异，包括核糖体进入和翻译暂停的速率不同。这样，mRNA的水平不一定直接代表细胞中发现的蛋白质水平。为了确定一种更精确的方法来测量细胞中蛋白质的表达，与核糖体有关的mRNA水平的分析正在被采用。借助NGS技术，使用称为Ribo-Seq或核糖体谱分析的方法确定了核糖体的单核苷酸分辨率印迹。这种方法可以对翻译进行高通量的测量在体内，进一步分析以确定蛋白质的合成速率，翻译暂停和细胞对各种环境变化的反应。在这里，我们描述了细菌中Ribo-Seq的简单分析流程，即所谓的Ribo-Seq（STATR）的简单Translatome分析工具。STATR可用于进行Ribo-Seq数据的主要处理，随后可进行从实验验证到深入分析的多级翻译研究。这里提供了逐个命令的说明，以使广泛的生物学家可以轻松地重现分析。



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