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与核小体结合的 SWI/SNF 染色质重塑剂 RSC 的结构
Nature ( IF 50.5 ) Pub Date : 2020-03-11 , DOI: 10.1038/s41586-020-2088-0
Felix R Wagner 1 , Christian Dienemann 1 , Haibo Wang 1 , Alexandra Stützer 2 , Dimitry Tegunov 1 , Henning Urlaub 2, 3 , Patrick Cramer 1
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更新日期:2020-03-11
Nature ( IF 50.5 ) Pub Date : 2020-03-11 , DOI: 10.1038/s41586-020-2088-0
Felix R Wagner 1 , Christian Dienemann 1 , Haibo Wang 1 , Alexandra Stützer 2 , Dimitry Tegunov 1 , Henning Urlaub 2, 3 , Patrick Cramer 1
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SWI/SNF 家族的染色质重塑复合物在核小体耗尽的转录活性启动子区域 (NDR) 1,2的形成中发挥作用。在酵母酿酒酵母中,必需的 SWI/SNF 复合物 RSC 3包含 16 个亚基,包括 ATP 依赖性 DNA 转位酶 Sth1 4,5。RSC 从启动子区域6,7中去除核小体,并定位位于 NDR 8,9两侧的特化 +1 和 -1 核小体. 在这里,我们展示了与核小体底物复合的 RSC 的低温电子显微镜结构。该结构揭示了 RSC 形成五个蛋白质模块,并提出了重塑机制的关键特征。身体模块充当四个灵活模块的支架,我们称之为 DNA 相互作用、ATP 酶、手臂和肌动蛋白相关蛋白 (ARP) 模块。DNA 相互作用模块结合核小体外 DNA 并参与识别影响 RSC 功能12的启动子 DNA 元件8、10、11. ATPase 和 arm 模块将核小体盘与 Snf2 ATP 偶联 (SnAC) 结构域和手指螺旋分别夹在中间。ATPase 模块的转位酶马达在超螺旋位置 +2 处与核小体的边缘接合。移动 ARP 模块可以调节转位酶-核小体相互作用以调节 RSC 活性5。RSC-核小体结构为了解 NDR 的形成以及人类 SWI/SNF 复合物的结构和功能提供了基础,这些复合物在癌症中经常发生突变13。

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