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嗜热菌HB8转录因子TTHB023的一般和基因组DNA结合特异性。
Biomolecules ( IF 4.8 ) Pub Date : 2020-01-06 , DOI: 10.3390/biom10010094
James Shell Cox 1, 2 , Michael W Van Dyke 1
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转录因子是识别特定DNA序列并影响局部转录过程的蛋白质。它们是所有生物控制特定基因表达的主要手段。了解特定转录因子识别的DNA序列为它们调控的基因集以及由此产生的潜在生物学功能提供了重要线索。洞察力可以通过同源搜索和遗传手段获得。但是,这些方法可能会产生误导,尤其是在比较远距离相关的生物或复杂的转录调控情况下。在这项工作中,我们使用了一种基于生物化学的方法来确定由嗜热栖热菌HB8 TetR-家族转录因子TTHB023特异性结合的DNA序列的光谱。共有序列5' 发现-(a / c)Y(g / t)A(A / C)YGryCR(g / t)T(c / a)R(g / t)-3'与TTHB023具有纳摩尔结合亲和力。分析嗜热衣原体HB8基因组,将几个TTHB023共有结合位点定位到参与脂肪酸生物合成的基因的启动子上。值得注意的是,这些基因中的一些以前并未通过遗传方法鉴定出来,表面上看,它们可能被嗜热栖性热菌HB8 TetR-家族转录阻遏物TTHA0167共同调控。我们的研究提供了额外的证据,支持基于生物化学的方法来表征推定的转录因子,特别是在合作调节的情况下。将几个TTHB023共有结合位点定位到与脂肪酸生物合成有关的基因的启动子上。值得注意的是,这些基因中的一些以前并未通过遗传方法鉴定出来,表面上看,它们可能被嗜热栖性热菌HB8 TetR-家族转录阻遏物TTHA0167共同调控。我们的研究提供了额外的证据,支持基于生物化学的方法来表征推定的转录因子,特别是在合作调节的情况下。将几个TTHB023共有结合位点定位到与脂肪酸生物合成有关的基因的启动子上。值得注意的是,这些基因中的一些以前并未通过遗传方法鉴定出来,表面上看,它们可能被嗜热栖性热菌HB8 TetR-家族转录阻遏物TTHA0167共同调控。我们的研究提供了额外的证据,支持基于生物化学的方法来表征推定的转录因子,特别是在合作调节的情况下。



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更新日期:2020-01-06
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