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Loss-of-function variants in CTNNA1 detected on multigene panel testing in individuals with gastric or breast cancer.
Genetics in Medicine ( IF 6.6 ) Pub Date : 2020-02-13 , DOI: 10.1038/s41436-020-0753-1
Dana Farengo Clark 1 , Scott T Michalski 2 , Rashmi Tondon 3 , Bita Nehoray 4 , Jessica Ebrahimzadeh 1 , Sarah Kate Hughes 5 , Emily R Soper 6 , Susan M Domchek 1 , Anil K Rustgi 7 , Daniel Pineda-Alvarez 2 , Michael J Anderson 2 , Bryson W Katona 8
Genetics in Medicine ( IF 6.6 ) Pub Date : 2020-02-13 , DOI: 10.1038/s41436-020-0753-1
Dana Farengo Clark 1 , Scott T Michalski 2 , Rashmi Tondon 3 , Bita Nehoray 4 , Jessica Ebrahimzadeh 1 , Sarah Kate Hughes 5 , Emily R Soper 6 , Susan M Domchek 1 , Anil K Rustgi 7 , Daniel Pineda-Alvarez 2 , Michael J Anderson 2 , Bryson W Katona 8
Affiliation
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PURPOSE
CTNNA1 is a potential diffuse gastric cancer risk gene, however CTNNA1 testing on multigene panel testing (MGPT) remains unstudied.
METHODS
De-identified data from 151,425 individuals who underwent CTNNA1 testing at a commercial laboratory between October 2015 and July 2019 were reviewed. Tissue α-E-catenin immunohistochemistry was performed on CTNNA1 c.1351C>T (p.Arg451*) carriers.
RESULTS
Fifty-two individuals (0.03% tested) had CTNNA1 loss-of-function (LOF) variants and 1057 individuals (0.7% tested) had a total of 302 distinct missense variants of uncertain significance. Detailed history was available on 33 CTNNA1 LOF carriers, with 21 unique CTNNA1 LOF variants. Four (12%) individuals had diffuse gastric cancer and 22 (67%) had breast cancer. Six (21%) and 24 (83%) of the 29 families reported a history of gastric or breast cancer, respectively. The CTNNA1 c.1351C>T nonsense variant was identified in three separate families with early-onset diffuse gastric cancer or breast cancer. Immunohistochemistry showed decreased α-E-catenin expression in gastric cancers.
CONCLUSION
CTNNA1 LOF variants are detected on MGPT with a majority of these individuals having gastric or breast cancer. The overall risk of gastric cancer for CTNNA1 LOF carriers may be lower than expected. Given the uncertain phenotype and penetrance, management of individuals with CTNNA1 LOF variants remains challenging.
中文翻译：
在胃癌或乳腺癌患者的多基因面板测试中检测到 CTNNA1 的功能丧失变异。
目的 CTNNA1 是一种潜在的弥漫性胃癌风险基因，但多基因组合检测 (MGPT) 上的 CTNNA1 检测仍未得到研究。方法审查了 2015 年 10 月至 2019 年 7 月期间在商业实验室接受 CTNNA1 测试的 151,425 人的去识别数据。在 CTNNA1 c.1351C>T (p.Arg451*) 载体上进行组织 α-E-连环蛋白免疫组织化学。结果 52 人（0.03% 测试）具有 CTNNA1 功能丧失（LOF）变体，1057 人（0.7% 测试）总共有 302 个不同的意义不确定的错义变体。提供了 33 个 CTNNA1 LOF 载体的详细历史记录，其中包含 21 个独特的 CTNNA1 LOF 变体。4 人 (12%) 患有弥漫性胃癌，22 人 (67%) 患有乳腺癌。29 个家庭中有 6 个（21%）和 24 个（83%）报告有胃癌或乳腺癌病史，分别。CTNNA1 c.1351C>T 无义变体在三个具有早发性弥漫性胃癌或乳腺癌的独立家族中被发现。免疫组织化学显示胃癌中 α-E-catenin 表达降低。结论 在 MGPT 上检测到 CTNNA1 LOF 变体，其中大多数人患有胃癌或乳腺癌。CTNNA1 LOF 携带者患胃癌的总体风险可能低于预期。鉴于不确定的表型和外显率，具有 CTNNA1 LOF 变异的个体的管理仍然具有挑战性。结论 在 MGPT 上检测到 CTNNA1 LOF 变体，其中大多数人患有胃癌或乳腺癌。CTNNA1 LOF 携带者患胃癌的总体风险可能低于预期。鉴于不确定的表型和外显率，具有 CTNNA1 LOF 变异的个体的管理仍然具有挑战性。结论 在 MGPT 上检测到 CTNNA1 LOF 变体，其中大多数人患有胃癌或乳腺癌。CTNNA1 LOF 携带者患胃癌的总体风险可能低于预期。鉴于不确定的表型和外显率，具有 CTNNA1 LOF 变异的个体的管理仍然具有挑战性。
更新日期：2020-02-13
中文翻译：
在胃癌或乳腺癌患者的多基因面板测试中检测到 CTNNA1 的功能丧失变异。
目的 CTNNA1 是一种潜在的弥漫性胃癌风险基因，但多基因组合检测 (MGPT) 上的 CTNNA1 检测仍未得到研究。方法审查了 2015 年 10 月至 2019 年 7 月期间在商业实验室接受 CTNNA1 测试的 151,425 人的去识别数据。在 CTNNA1 c.1351C>T (p.Arg451*) 载体上进行组织 α-E-连环蛋白免疫组织化学。结果 52 人（0.03% 测试）具有 CTNNA1 功能丧失（LOF）变体，1057 人（0.7% 测试）总共有 302 个不同的意义不确定的错义变体。提供了 33 个 CTNNA1 LOF 载体的详细历史记录，其中包含 21 个独特的 CTNNA1 LOF 变体。4 人 (12%) 患有弥漫性胃癌，22 人 (67%) 患有乳腺癌。29 个家庭中有 6 个（21%）和 24 个（83%）报告有胃癌或乳腺癌病史，分别。CTNNA1 c.1351C>T 无义变体在三个具有早发性弥漫性胃癌或乳腺癌的独立家族中被发现。免疫组织化学显示胃癌中 α-E-catenin 表达降低。结论 在 MGPT 上检测到 CTNNA1 LOF 变体，其中大多数人患有胃癌或乳腺癌。CTNNA1 LOF 携带者患胃癌的总体风险可能低于预期。鉴于不确定的表型和外显率，具有 CTNNA1 LOF 变异的个体的管理仍然具有挑战性。结论 在 MGPT 上检测到 CTNNA1 LOF 变体，其中大多数人患有胃癌或乳腺癌。CTNNA1 LOF 携带者患胃癌的总体风险可能低于预期。鉴于不确定的表型和外显率，具有 CTNNA1 LOF 变异的个体的管理仍然具有挑战性。结论 在 MGPT 上检测到 CTNNA1 LOF 变体，其中大多数人患有胃癌或乳腺癌。CTNNA1 LOF 携带者患胃癌的总体风险可能低于预期。鉴于不确定的表型和外显率，具有 CTNNA1 LOF 变异的个体的管理仍然具有挑战性。
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