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ARK分析是一种全面检测DNA-蛋白质交联的灵敏且多功能的方法。
Cell Reports ( IF 7.5 ) Pub Date : 2020-01-28 , DOI: 10.1016/j.celrep.2019.12.067 Qianghua Hu 1 , Naeh Klages-Mundt 1 , Rui Wang 1 , Erica Lynn 1 , Liton Kuma Saha 2 , Huimin Zhang 1 , Mrinal Srivastava 1 , Xi Shen 1 , Yanyan Tian 1 , Hyeung Kim 1 , Yin Ye 1 , Tanya Paull 3 , Shunichi Takeda 2 , Junjie Chen 1 , Lei Li 1
Cell Reports ( IF 7.5 ) Pub Date : 2020-01-28 , DOI: 10.1016/j.celrep.2019.12.067 Qianghua Hu 1 , Naeh Klages-Mundt 1 , Rui Wang 1 , Erica Lynn 1 , Liton Kuma Saha 2 , Huimin Zhang 1 , Mrinal Srivastava 1 , Xi Shen 1 , Yanyan Tian 1 , Hyeung Kim 1 , Yin Ye 1 , Tanya Paull 3 , Shunichi Takeda 2 , Junjie Chen 1 , Lei Li 1
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DNA-蛋白质交联(DPC)是DNA损伤的一种常见形式,在多种DNA交易中具有强烈的抑制作用。尽管有最近的发展,DPC的生化检测仍是深入了解DPC修复机理的限制因素。在这里,我们开发了一种灵敏且通用的测定法,称为ARK,用于定量分析细胞中的DPC。ARK使用顺序离液和基于去污剂的DPC隔离,可显着提高样品纯度,从而使检测灵敏度提高5倍,背景读数降低10倍。我们验证了具有DPC修复中已建立缺陷的遗传突变体的ARK分析,并通过使用常见的DPC诱导剂(包括甲醛,喜树碱和依托泊苷)证明了其稳健性。此外,我们显示Fanconi贫血途径有助于DPC的修复。因此,ARK有望促进旨在了解DNA蛋白质交联修复的基础生物学和翻译应用的各种研究。
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更新日期:2020-01-29
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