根据最新数据，微生物应被解释为能够交流和集体行为的生物。微生物通讯信号既涉及微生物社会系统（包括居住于人体的微联盟）内的微生物细胞之间的相互作用，也涉及微生物群与宿主生物之间的对话。微生物群栖息在宿主生物的各个生态位中，尤其是胃肠道。微生物释放出各种信号分子，此外，还对宿主信号产生特异性反应。这使他们能够不断与神经系统相互作用，包括大脑和宿主生物体的免疫系统。微生物群与宿主之间的通信中涉及的进化保守信号包括神经活性物质（神经化学物质），例如肽，氨基酸，生物胺，短链脂肪酸和气态物质。正在进行的对话可能会稳定宿主的身心健康状态，或者会导致严重的健康问题。人们尝试用益生菌（包括其称为精神抗生素的亚组）来纠正脑肠微生物群轴的失衡。释放出直接影响人脑，心理和行为的神经活性物质。最近的许多评论工作都针对微生物菌群-宿主系统及其通讯信号。一些出版物着重于神经化学物质参与宿主－菌群系统内的双向交流。但是，这项工作集中在细菌细胞成分，代谢物和信号分子的影响上，以作为目前普遍存在的既有优点也有缺点的益生菌的有前途的替代方法。这样的微生物来源的生物活性剂被称为后生物或替代生物（在这项工作中优选的术语）。



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