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从乙酰赖氨酸模拟配体靶向赖氨酸乙酰转移酶PCAF溴结构域解开新的同源物。
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics ( IF 2.7 ) Pub Date : 2017-12-13 , DOI: 10.1080/07391102.2017.1415820
Venkatesan Suryanarayanan 1 , Sanjeev Kumar Singh 1
Affiliation  

p300 / CBP相关因子(PCAF)溴结构域(BRD)(赖氨酸乙酰转移酶)已成为有希望的药物靶标,因为其功能障碍与多种疾病(如癌症,糖尿病,艾滋病等)的发作和进展有关。基于PCAF BRD的乙酰赖氨酸模拟抑制剂,生成了三种具有特征的E-药基(ARR),该抑制剂可以作为共晶结构使用(PDB ID:5FDZ)。它用于过滤小分子数据库,然后进行分子对接,因此使用富集计算进行了验证。发现产生的命中是同源物,其显示了E-Pharmacophore假说的预测能力。此外,进行了诱导拟合对接方法,结合能计算,ADME预测,单点能量计算和分子动力学模拟,以发现针对PCAF BRD的更好命中。根据结果​​,可以得出结论,Asn803,Tyr809和Tyr802以及水分子(HOH1001)在与抑制剂结合中起着至关重要的作用。还建议从生命化学数据库中选择四个命中点,即F2276-0099,F2276-0008,F2276-0104和F2276-0106,作为PCAF BRD的有效药物分子。因此,坚信本研究对PCAF BRD抑制剂的有效和新颖同源物的合理药物设计具有光明的影响。



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更新日期:2019-11-01
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