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8-氨基-7-氧代壬酸合酶的机制:光谱,动力学和晶体学研究。
Biochemistry ( IF 2.9 ) Pub Date : 2000-01-21 , DOI: 10.1021/bi991620j
S P Webster 1 , D Alexeev , D J Campopiano , R M Watt , M Alexeeva , L Sawyer , R L Baxter
Affiliation  

8-Amino-7-oxononanoate合酶(也称为7-keto-8-氨基壬酸合酶,EC 2.3.1.47)是吡咯醛5'-磷酸盐依赖性酶,可催化L-丙氨酸与庚二酰-CoA的脱羧缩合。以立体定向的方式形成8(S)-氨基-7-氧代壬酸酯。这是生物素生物合成的第一步。大肠杆菌AONS的机理已通过光谱,动力学和晶体学技术进行了研究。完整酶的X射线结构已以1.7 A的分辨率精制(R = 18.6%,R(游离)=21。2%),显示内部醛亚胺的亚胺键平面偏离吡啶飞机。酶-产品外部亚胺亚胺复合物的结构已以2.0 A的分辨率精制(R = 21.2%,R(free)= 27。8%),并显示吡啶环相对于内部醛亚胺的旋转,以及C端结构域的显着构象变化和活性位点氢键的细微重排。反应的第一步是L-丙氨酸外部醛亚胺的形成,反应迅速(k(1)= 2 x 10(4)M(-)(1)s(-)(1))。用D-丙氨酸(不是底物)形成外部醛亚胺的速度明显较慢(k(1)= 125 M(-)(1)s(-)(1))。在庚二酰辅酶A存在下,D-丙氨酸与AONS的结合增强了约2倍。仅在向预先形成的L-丙氨酸外部醛亚胺络合物中添加庚二酰-CoA时,才发生显着的底物醌类形成,并且其之前存在明显的滞后相(约30 ms),这表明庚二酰-CoA的结合会导致酶的构象转变外部醛亚胺络合物。这种转变是通过建模推断的,要求围绕外部醛亚胺络合物的Calpha-N键进行旋转,从而促进了Lys236对Calpha质子的提取。这些结果已合并形成AONS催化的详细机理途径,该途径可应用于α-氧胺合酶亚家族的其他成员。促进Lys236对Calpha质子的抽象。这些结果已合并形成AONS催化的详细机理途径,该途径可应用于α-氧胺合酶亚家族的其他成员。促进Lys236对Calpha质子的抽象。这些结果已合并形成AONS催化的详细机理途径,该途径可应用于α-氧胺合酶亚家族的其他成员。



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更新日期:2019-11-01
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