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在计算机上鉴定和表征人FOXN5和大鼠Foxn5基因。
International Journal of Oncology ( IF 4.5 ) Pub Date : 2004-04-07
Masuko Katoh 1 , Masaru Katoh
Affiliation  

前叉箱基因(FOX)通过依赖SHH-GLI途径,TGF-β途径等的转录调控参与胚胎发生,并通过基因扩增,逆转录病毒整合和染色体易位参与癌变。FOXN1,FOXN2(HTLF),FOXN3(CHES1)和FOXN4构成FOXN家族。在这里,我们通过使用生物信息学鉴定并表征了FOXN5基因家族的新成员FOXN5基因。IMAGE5167039(BC028191.1)是源自人FOXN5基因的代表性cDNA。在大鼠基因组序列CH230-26K11(AC107575.5)中鉴定到了由六个外显子组成的Rat Foxn5基因。通过组装大鼠Foxn5外显子的核苷酸序列确定大鼠Foxn5 cDNA的完整编码序列。人FOXN5(292 aa)和大鼠Foxn5(296 aa)显示77.4%的总氨基酸同一性。FOXN5的密码子173-254是Forkhead域。由六个外显子组成的FOXN5基因在人染色体11q23.3与BCL9L基因连锁。FOXN5是候选肿瘤抑制基因(TSG),与ARHGAP20(KIAA1391),BTG4,SNF1LK2(SIK2),DIXDC1(KIAA1735)基因位于11q23.1、11q23.2具有TTC12(TPARM)基因,IGSF4,DSCAML1,LL5A (PHLDB1),BCL9L,RNF26和MFRP基因位于11q23.3。这是关于人类FOXN5和大鼠Foxn5基因的首次报道。



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更新日期:2019-11-01
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