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HepaRG细胞和HepG2细胞与原代人肝细胞和人肝组织的全基因组基因表达谱的比较。
Drug Metabolism and Disposition ( IF 4.4 ) Pub Date : 2010-03-17 , DOI: 10.1124/dmd.109.031831
Steven N Hart 1 , Ye Li , Kaori Nakamoto , Eva-anne Subileau , David Steen , Xiao-bo Zhong
Affiliation  

源自女性肝癌患者的HepaRG细胞能够分化为胆管上皮细胞和肝细胞。更重要的是,分化的HepaRG细胞能够维持许多异种生物代谢酶的活性,并且异种生物可以诱导代谢酶基因的表达。这些细胞表达和诱导异种代谢酶的能力与经常使用的HepG2细胞形成鲜明对比。先前的研究主要集中在一组选定的基因上。因此,与原代人肝细胞和人肝组织相比,了解HepaRG细胞和HepG2细胞在全基因组水平上基因表达的相似程度具有重大意义。为了实现此目标,我们使用了Affymetrix(加利福尼亚州圣克拉拉)U133 Plus 2。0个阵列可表征来自HepG2细胞,HepaRG细胞(未分化和分化的细胞),新鲜分离的原代人肝细胞和冷冻肝组织的一式三份生物学样品中的全基因组基因表达谱。在使用相似性矩阵,主要成分和层次聚类方法后,我们发现,HepaRG细胞以比人HepG2细胞更类似于人原代肝细胞和人肝组织的水平转录基因。特别是,与原代人肝细胞和肝样品相比,许多编码药物加工蛋白的基因在HepaRG细胞中的转录水平比在HepG2细胞中的转录水平更高。HepaRG与人类原代肝细胞的转录组相似性令人鼓舞,可用于HepaRG细胞在异源代谢,肝毒理学,



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更新日期:2019-11-01
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