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GlycoMod-一种用于根据质谱数据确定糖基化组成的软件工具。
Proteomics ( IF 3.4 ) Pub Date : 2001-10-30 , DOI: 10.1002/1615-9861(200102)1:2<340::aid-prot340>3.0.co;2-b
C A Cooper 1 , E Gasteiger , N H Packer
Proteomics ( IF 3.4 ) Pub Date : 2001-10-30 , DOI: 10.1002/1615-9861(200102)1:2<340::aid-prot340>3.0.co;2-b
C A Cooper 1 , E Gasteiger , N H Packer
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GlycoMod(http://www.expasy.ch/tools/glycomod/)是一种软件工具,旨在从其实验确定的质量中查找聚糖结构的所有可能组成。该程序可用于预测任何糖蛋白衍生的寡糖的组成,该寡糖包括未衍生的,甲基化或乙酰化的单糖或具有衍生化的还原末端。如果已知肽的序列或质量,则可以计算与肽连接的聚糖的组成。此外,如果该蛋白质已知并且包含在SWISS-PROT或TrEMBL数据库中,该程序将使实验确定的质量与所有可能由N-或O-连接的寡糖进行糖基化的预测的蛋白酶产生的肽(包括这些数据库中注释的任何翻译后修饰)相匹配。由于可以从相同质量产生许多可能的聚糖成分,因此如果用户提供已知或可疑的单糖成分,则程序可以将成分限制应用于输出。此外,对程序中单糖组成的已知寡糖结构限制也被合并到程序中以限制输出。如果用户提供已知或可疑的单糖成分,则程序可以将成分限制应用于输出。此外,对程序中单糖组成的已知寡糖结构限制也被合并到程序中以限制输出。如果用户提供已知或可疑的单糖成分,则程序可以将成分限制应用于输出。此外,对程序中单糖组成的已知寡糖结构限制也被合并到程序中以限制输出。
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更新日期:2019-11-01

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