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真菌葡萄糖醛酸酯酶：基于基因组挖掘的酶发现和生化表征
New Biotechnology ( IF 4.5 ) Pub Date : 2018-01-01 , DOI: 10.1016/j.nbt.2017.10.003 Adiphol Dilokpimol 1 , Miia R Mäkelä 2 , Gabriella Cerullo 3 , Miaomiao Zhou 1 , Simona Varriale 3 , Loknath Gidijala 4 , Joana L A Brás 5 , Peter Jütten 6 , Alexander Piechot 6 , Raymond Verhaert 4 , Vincenza Faraco 3 , Kristiina S Hilden 2 , Ronald P de Vries 1
New Biotechnology ( IF 4.5 ) Pub Date : 2018-01-01 , DOI: 10.1016/j.nbt.2017.10.003 Adiphol Dilokpimol 1 , Miia R Mäkelä 2 , Gabriella Cerullo 3 , Miaomiao Zhou 1 , Simona Varriale 3 , Loknath Gidijala 4 , Joana L A Brás 5 , Peter Jütten 6 , Alexander Piechot 6 , Raymond Verhaert 4 , Vincenza Faraco 3 , Kristiina S Hilden 2 , Ronald P de Vries 1
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4-O-甲基-d-葡糖醛酸 (MeGlcA) 是葡糖醛酸阿拉伯木聚糖的副残基，可与木质素形成酯键，对植物细胞壁的强度和刚度有显着贡献。葡糖醛酸酯酶（4-O-甲基-葡糖醛酸甲酯酶，GEs）可以裂解这种酯键，因此可以在生物质糖化中作为辅助酶发挥重要作用，用于生产生物燃料和生化产品。GEs 属于 CAZy 数据库 (www.cazy.org) 中一个相对较新的碳水化合物酯酶家族 (CE15)，到目前为止，大约有十种真菌 GEs 已被表征。为了探索更多的 GE 酶，我们使用了基因组挖掘策略。BLAST 分析对大约 250 个可公开访问的真菌基因组进行了表征 GEs，鉴定了 150 多个假定的真菌 GEs，分为八个系统发育亚组。为了验证基因组挖掘策略，在毕赤酵母中异源地产生了来自子囊菌和担子菌真菌的 21 个选定的 GE。在这些酶中，18 种对 d-葡萄糖醛酸苄酯具有活性，这表明我们的基因组挖掘策略适用于酶发现。
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更新日期：2018-01-01
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