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短DNA分子的J因子
The Journal of Chemical Physics ( IF 3.1 ) Pub Date : 2016-06-03 12:32:21 , DOI: 10.1063/1.4952978
Marco Zoli 1
The Journal of Chemical Physics ( IF 3.1 ) Pub Date : 2016-06-03 12:32:21 , DOI: 10.1063/1.4952978
Marco Zoli 1
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通过介观哈密顿方法研究短DNA序列转化为圆形形式的倾向，该方法结合了分子轴的弯曲和DNA链的固有扭曲。相对于螺旋直径的碱基对波动被视为假想时间路径积分形式中的路径轨迹。通过将链端边界条件施加在径向波动和自由角上，可以计算出封闭分子子集合的分配函数。事实证明，环化概率J因子对堆积势高度敏感，主要是对其非线性参数敏感。我们发现J因子通常会通过减少序列长度（N），更重要的是，低于N = 100个碱基对。但是，即使对于非常小的分子，J因子仍然保持可观的大小，这与最近的实验结果相符。相邻碱基对之间的大弯曲角度和非谐叠堆似乎是在短长度范围内产生螺旋柔韧性的原因。
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更新日期：2016-06-04
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