RNA结合蛋白（RBP）在协调真核生物中RNA代谢的几个步骤中至关重要，从而控制了RBP-RNA相互作用的广泛网络。在这里，我们采用了60个人RBP的CLIP（交联免疫沉淀）-seq数据集和69个酵母RBP的RIP-ChIP（RNP免疫沉淀-微阵列）数据来构建每个RBP的全基因组RBP-靶RNA相互作用网络。我们在人类中显示，大多数（约78％）RBP在转录本水平上与它们的目标转录本密切相关，而当蛋白质的表达水平为5％时，约95％的研究RBP也与目标转录本的表达水平密切相关。使用了RBP。在转录本水平上，酵母基因组的RBP-RNA相互作用数据显示63％的RBP具有很强的关联性，确认该关联在较大的系统发育距离上均得到保守。通过分析发现有助于这些关联的特征，可以揭示目标转录本的数量和RBP所选蛋白质编码转录本在转录本水平上的长度，而CLIP信号的强度，RNA结合结构域的数量，结合位点的位置在转录本上，在蛋白质水平上非常重要。我们的分析将有助于改进转录后网络的建模和预测。结合位点在转录本上的位置，在蛋白质水平上非常重要。我们的分析将有助于改进转录后网络的建模和预测。结合位点在转录本上的位置，在蛋白质水平上非常重要。我们的分析将有助于改进转录后网络的建模和预测。



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