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病毒衣壳作为药物靶标的全原子分子动力学
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2016-05-04 00:00:00 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.6b00517
Juan R. Perilla 1 , Jodi A. Hadden 1 , Boon Chong Goh 1 , Christopher G. Mayne 1 , Klaus Schulten 1
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病毒衣壳是包装病毒基因组的蛋白质壳。尽管衣壳的形态和生物学功能可以发生显着变化,但衣壳通常在调节病毒感染途径中起关键作用。对病毒衣壳的详细了解,包括其动态结构,与细胞因子的相互作用以及它们在复制周期中所起的特定作用,对于开发抗病毒治疗剂至关重要。下面的“观点”介绍了计算生物学的一个新兴领域,该领域侧重于病毒衣壳和衣壳蛋白装配体的动力学,特别着重于小分子药物结合对衣壳结构,稳定性和变构途径的影响。当按化学细节进行时,分子动力学模拟可以揭示由药物分子诱导的病毒衣壳的细微变化,其大小仅为其大小的一小部分。在这里,讨论了进行全原子衣壳-药物模拟的当前挑战,以及对病毒衣壳模拟显示新药物靶标的适用性的展望。



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更新日期:2016-05-04
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