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设计者五肽重复蛋白识别特异性单链 RNA 的结构基础。
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2016-Apr-18 , DOI: 10.1038/ncomms11285
Cuicui Shen 1 , Delin Zhang 1 , Zeyuan Guan 1 , Yexing Liu 2 , Zhao Yang 1 , Yan Yang 1 , Xiang Wang 1 , Qiang Wang 1 , QunXia Zhang 1 , Shilong Fan 2 , Tingting Zou 1 , Ping Yin 1
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作为 RNA 结合蛋白的一大家族,五肽重复序列 (PPR) 蛋白介导真核生物中 RNA 代谢的多个方面。PPR 蛋白以模块化和碱基特异性的方式与其目标单链 RNA (ssRNA) 结合,可以作为基因操作的可设计模块。然而,设计者 PPR (dPPR) 蛋白的核苷酸特异性识别的结构基础仍有待阐明。在这里,我们报告了 dPPR 蛋白的四种晶体结构及其各自的 ssRNA 靶标。dPPR 重复序列被组装成一个右手超螺旋螺旋壳,包围着 ssRNA。在原子水平上观察到不同 PPR 代码和 RNA 碱基之间的相互作用,揭示了 RNA 碱基 U、C、A 和 G 的模块化和特异性识别模式的分子基础。



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更新日期:2016-04-21
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