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通过红外激光脉冲比较B-DNA和Z-DNA的熔解和愈合
The Journal of Chemical Physics ( IF 3.1 ) Pub Date : 2016-04-12 15:15:12 , DOI: 10.1063/1.4945340 Viet Hoang Man 1 , Feng Pan 1 , Celeste Sagui 1 , Christopher Roland 1
The Journal of Chemical Physics ( IF 3.1 ) Pub Date : 2016-04-12 15:15:12 , DOI: 10.1063/1.4945340 Viet Hoang Man 1 , Feng Pan 1 , Celeste Sagui 1 , Christopher Roland 1
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我们探索使用快速激光熔融模拟方法与原子分子动力学模拟相结合的方法，以确定具有相同d（5'-CGCGCGCGCGCG-3'）2的B-DNA和Z-DNA十二聚体的熔融和愈合反应顺序。专门调节激光脉冲的频率以破坏沃森-克里克氢键，从而诱导DNA双链体的解链。随后，根据场强，结构松弛并部分重折叠。除了对非平衡解链过程的内在兴趣外，我们提议通过红外激光脉冲快速解链可以用作一种技术，用于快速比较具有不同二级结构的相同序列寡核苷酸的相对稳定性，并具有完整的原子细节。结构和溶剂。这对于涉及非规范碱基对，错配等的非标准二级结构特别有用。
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更新日期：2016-04-13
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