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酶促不对称Mannich反应合成无保护的手性α,β-二氨基酸

α,β-二氨基酸不仅是许多具有生物活性的天然产物、多肽类似物和药物的关键结构基团,还是二胺类配体化合物的合成前体。尽管目前已有多种方法可用于制备α,β-二氨基酸,但这些方法往往受限于原料的预官能化处理或底物适用范围的局限。


近期,加利福尼亚大学圣芭芭拉分校Yang Hai课题组采用酶功能定向进化策略,成功开发了一种PLP依赖型的分子间Mannichase,能够催化游离α-氨基酸与环状亚胺之间的立体选择性Mannich反应,展现出卓越的对映选择性和良好的非对映选择性。这一创新方法已被成功应用于L-tambroline的克级规模合成。此外,通过与不同亚胺生成酶的串联,研究团队构建了一个多功能生物催化级联平台,为合成结构复杂且含连续立体中心的α,β-二氨基酸提供了一种通用、简洁及原子经济的新途径。


2023年,Yang Hai课题组成功阐释了天然产物loline的pyrrolizidine骨架的生物合成机制 (下图a),并首次发现了一种依赖于PLP的Mannich cyclase (LolT)。模型反应的结果 (下图b) 表明,LolT能够催化Δ1-pyrroline (5) 与glycine (6) 之间的分子间Mannich反应,尽管初始反应收率仅为4-5%。通过稳态动力学分析 (下图c) 揭示,glycine的Km值为65 mM。为了优化此反应,研究团队将glycine (6) 的起始浓度设定为100 mM。在此标准条件下 (下图b, entry 8),LolT野生型以10%的收率成功获得了目标产物 (78),并展现出优异的对映选择性和非对映选择性 (16:1 dr, ee > 99%)。


通过采用迭代饱和诱变 (ISM) 方法对LolT进行工程化,旨在提升其在分子间Mannich反应中的效率。经过对24个氨基酸位点的细致筛选,成功鉴定出5个显著增强反应活性的突变 (下图a)。其中,虽然LolTv5突变体将反应收率提高至80%,但其非对映选择性较差(3:1 dr)。相比之下,LolTv4不仅保持了理想的反应收率,而且表现出更优的非对映选择性(14:1 dr)。稳态动力学分析 (下图b) 表明,与野生型相比,LolTv4在催化分子间Mannich反应的速率提高了60倍,同时glycine的Km值也降至33 mM。基于这些优化后的数据,调整Δ1-pyrroline (5) 与glycine (6) 的起始投料比例,并成功地将该方法应用于L-tambroline的克级规模合成。


本文首次报道了lolTv4能够催化retro-Mannich反应,尽管其正向反应的速率约为逆反应的八百倍。为了深入探讨lolTv4在催化分子间Mannich反应中的机理,研究团队采用了X射线晶体学、定点突变实验和分子对接模拟等多种方法,提出了lolTv4在催化过程中可能的底物特异性、立体选择性和区域选择性的结构基础(下图c)。P427Y突变可能通过减小活性位点的体积,增强了对底物的识别能力,从而提高了反应活性;K236是一个关键的碱性残基,可能参与与PLP结合的glycine的去质子化。此外,Y125和W279的协同作用有助于环状亚胺底物的精确识别和定位。定点突变实验结果表明(下图b),W279介导的π-π相互作用对于Mannich反应的非对映选择性至关重要。


接下来,研究团队进一步拓展PLP依赖型的分子间Mannichase的底物适用范围。通过与不同亚胺生成酶的串联应用,各种5-7元环状亚胺以及刚性双环亚胺都可以作为PLP依赖型分子间Mannichase的底物,极大地拓宽了其合成应用范围。另一方面,氨基酸底物的适用范围也十分广泛, 从非极性的L-alanine (10, 14, 19) 到极性的L-serine (9, 15, 21),以及从带负电的L-aspartic acid (11) 到带正电的L-2,3-diaminopropionic acid (12)。


综上,该研究成功地将PLP依赖型的Mannich cyclase转化为分子间Mannichase。通过这一改造,LolTv4在催化分子间Mannich反应的速率提高了60倍,同时glycine的Km值也降低了一倍,最终成功实现了L-tambroline的克级规模合成。这项工作为合成结构复杂且含连续立体中心的α,β-二氨基酸开辟了一条通用、简洁且符合原子经济原则的新途径。机理研究显示,W279介导的π-π相互作用在Mannich反应的非对映选择性中起着关键作用。尽管此类π-π相互作用在控制酶催化的非对映选择性中不常见,但这一发现也为未来相关酶转化的蛋白质设计与工程提供参考。


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Enzymatic Synthesis of Unprotected α,β-Diamino Acids via Direct Asymmetric Mannich Reactions

Shaonan Liu, Jinmin Gao, Yike Zou, and Yang Hai*

J. Am. Chem. Soc., 2024, DOI: 10.1021/jacs.4c05581


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