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舒朋 助理研究员,硕士    

方       向:生物信息学,联系方式:sp13737351728@163.com


主要成果:历任天演药业(苏州)有限公司计算化学助理,四川帕诺米克生物科技有限公司生信研发工程师。具有工程、生物学和大数据的交叉学科背景与工作经验,硕士毕业于四川大学生命科学学院生物学,研究方向为生物信息学。参与国家自然科学基金一项。共计发表SCI论文13篇,其中以第一(含共同)作者在中科院生物学一区期刊发表论文3篇,其中2篇高被引用论文,1篇Nature communications。在Development Cell、The Plant Cell、New phytol、Plant Physiology等国际知名期刊参与发表文章7篇。

【主要论文】

1. Bai F*, Shu P*, Deng H, Wu Y, Chen Y, Wu M, Ma T, Zhang Y, Pirrello J, Li Z, Hong Y, Bouzayen M+, Liu M+. A distal enhancer guides the negative selection of toxic glycoalkaloids during tomato domestication. Nat Commun. 2024 Apr 3;15(1):2894. doi: 10.1038/s41467-024-47292-7. PMID: 38570494; PMCID: PMC10991328. (中科院生物学一区TOP, IF5 17.0)

2. Shu P*, Zhang Z*, Wu Y, Chen Y, Li K, Deng H, Zhang J, Zhang X, Wang J, Liu Z, Xie Y, Du K, Li M, Bouzayen M, Hong Y, Zhang Y+, Liu M+. A comprehensive metabolic map reveals major quality regulations in red-flesh kiwifruit (Actinidia chinensis). New Phytol. 2023 Jun;238(5):2064-2079. doi: 10.1111/nph.18840. Epub 2023 Apr 4. PMID: 36843264. (中科院生物学一区TOP, IF5 10.5)

3. Wang R*, Shu P*, Zhang C*, Zhang J, Chen Y, Zhang Y, Du K, Xie Y, Li M, Ma T, Zhang Y, Li Z, Grierson D, Pirrello J, Chen K, Bouzayen M, Zhang B, Liu M. Integrative analyses of metabolome and genome-wide transcriptome reveal the regulatory network governing flavor formation in kiwifruit (Actinidia chinensis). New Phytol. 2022 Jan;233(1):373-389. doi: 10.1111/nph.17618. Epub 2021 Aug 4. PMID: 34255862. (中科院生物学一区TOP, IF5 10.5)

4. Dan Su*, Peng Shu*, Nan Hu#, Yuan Chen, Yi Wu, Heng Deng, Xiaofei Du, Xumeng Zhang, Ruochen Wang, Huajia Li, Yunliu Zeng, Dawei Li, Yue Xie, Mingzhang Li#, Yiguo Hong, Kaidong Liu#, Mingchun Liu# Dynamic m6A mRNA methylation reveals the involvement of AcALKBH10 in ripening-related quality regulation in kiwifruit. New Phytol (中科院生物学一区TOP, IF5 10.5)