我们研究团队致力于复杂疾病的基因组研究,主要研究人类癌症和发育疾病的分子机制,特别是遗传变异的功能注释和表观遗传调控网络。通过大规模的数据集成和数据挖掘来开发生物数据库、生物信息学工具和分析平台,以解析复杂疾病(如恶性肿瘤和发育疾病)的表观基因组和遗传调控规律。
(一)主持的科研项目
(1)国家自然科学基金:基于ctDNA甲基化图谱的肺癌液体活检及智能诊断,面上项目,32170656,2022/1 - 2025/12,主持人。
(2)北京市科委:基于循环肿瘤eccDNA的卵巢癌液体活检与智能诊断,北京市科技新星计划,Z211100002121039,2021/12 - 2024/12,主持人。
(二)专利或软件著作权
(1)AI-Driver:一种用于识别个人癌症基因组中驱动突变的集成方法(V1.0),2021SR2060531,原始取得,所有权利,2020.03.02 (软件版权)。
(2)OncoVar: 一个用于整合和分析肿瘤致癌驱动变异的数据库平台[简称:OncoVar] V1.2,2022SR1497736,原始取得,全部权利,2022.11.14 (软件版权)。
(3)OncoBase: 一个解码人类癌症调控体细胞突变的注释平台[简称:OncoBase] V1.1,2022SR1497737,原始取得,全部权利,2022.11.14 (软件版权)。
(4)CRISPRbase: 一个基于CRISPR介导的单碱基编辑知识库平台[简称:CRISPRbase] V1.0,2022SR1497738,原始取得,全部权利,2022.11.14 (软件版权)。
(三)主要研究方向
(1)早期胚胎发育机制及其在发育疾病的作用;
(2)单细胞深度学习模型及其在临床中的运用;
(3)肿瘤计算生物学及其在液体活检中的运用。