多肽模拟与设计实验室 Peptide Modelling and Design Lab by JiaqiWang (07.2024)

1. 自组装多肽筛选方法开发、组装机制研究、应用开发与产业化

方法开发

• 实验设计对自组装多肽预测准确率的影响
• 多肽特征提取对自组装多肽预测准确率的影响
• 人机交互法对自组装多肽预测准确率的影响
• 多肽二级结构的控制及其设定与转变对多肽自组装的影响

基础理论

• 多肽聚集与自组装分子机理（多肽自组装组学）
• 多肽自组装形貌形成机理与控制

应用设计

• 多肽基药物递送系统的开发
• 基于MD与AI的多肽基药物递送系统设计

2. 多肽药物筛选方法开发、多肽-多肽及多肽-蛋白互作机制研究

应用开发

• 水稻褐飞虱多肽防控药物
• 靶向PHLDA1蛋白的多肽抑制剂
• 穿膜多肽的预测及穿膜机制研究

基础理论

• 多肽-多肽（蛋白质）相互作用机制研究
• 多肽抑制后的蛋白功能转变研究

3. 多肽及蛋白医药功能材料的开发与研究

应用开发

• 多肽耦联的mRNA疫苗

基础研究

• 多肽油水界面动力学
• 蛋白与纳米颗粒超粒子组装动力学

4. 多肽医药功能材料开发平台

• 与牛顿力学解耦、基于深度学习加速的第一性原理分子动力学方法开发
• 基于结构生物学、量子分子模拟、人工智能的多肽医药功能材料开发平台