研究方向为环境微生物组学和合成生物学，主持国自然青年基金和国自然国际交流合作等多项横向和纵向项目。主要从事：1）人体微生物组学和分子营养组学:人体、环境/功能微生物组生态网络的解析、合成、重构、优化，挖掘环境微生物天然产物合成代谢途径及功能基因，并应用于医药产业、工农业中；2）健康食品/药品生物制造：挖掘植物及微生物中天然产物关键合成酶及代谢途径，利用合成生物学方法重新设计改造相关酶分子及代谢途径，并在酿酒酵母等微生物中高效合成。