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文章发表——空间转录组研究:模型小鼠脑海马区存在显著细胞异质性
发布时间:2023-02-03

  课题组贾腾同学于22年7月份顺利毕业后就职于徐州医科大学继续从事相关的科学研究工作,其博士期间有关帕金森病小鼠模型脑空间转录组的研究近日发表于International Journal of Molecular Science2023年最新一期。论文标题为:“Spatial Transcriptome Profiling of Mouse Hippocampal Single Cell Microzone in Parkinson’s Disease”。

工作亮点本研究通过显微切割技术从小鼠海马的不同空间位置获取74个单细胞样本,利用单细胞和空间转录组测序技术对组织切片中单细胞转录组特征进行可视化和量化。首次揭示帕金森疾病海马空间位置的单细胞转录组分布和异质性,并证明了帕金森病患者的学习和记忆能力受损受CA1和CA3亚区神经元基因协同效应的影响。本研究结果对于了解帕金森疾病的病理机制和制定精准的治疗方案起到指导作用。

附图:细胞类型鉴定及差异表达分析。(A)对照组和PD组单细胞微区样品的基因表达谱。(B)单细胞类型鉴定。(C) CN组和PD组单细胞微区样品差异表达的火山图。(D) (E) (F) (G)分别为Sv2b、Neurod6、Grp和Stk32b基因在不同空间位置的表达。(H)不同空间位置前10个特异性标记基因的基因表达谱。(I)海马区不同空间位置标记基因的网络图。CN:控制;PD:帕金森病。


出版信息Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(3), 1810; 原文链接:https://doi.org/10.3390/ijms24031810