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恭喜博士生胡凌峰关于鹅掌楸属花瓣中绿原酸合成的研究论文在Sci Hortic上顺利发表!
发布时间:2024-01-08

2024年1月18号,南京林业大学林木细胞工程课题组在Scientia Horticulturae上发表了题为 Combined non-targeted metabolomic and transcriptomic analysis explains the biosynthetic pathway and differential accumulation of chlorogenic acid in the Liriodendron petal 的文章,对鹅掌楸属植物花瓣代谢物以及在不同种花瓣之间的绿原酸合成通路以及差异性积累进行解析。

研究通过非靶向代谢组学对鹅掌楸属花瓣次生代谢物进行初步解析,这些代谢产物分为12类,包括有机杂环化合物(24.97%)、苯类化合物(22.21%)、有机酸及其衍生物(14.03%)、苯丙烷类和聚酮类化合物(12.27%)、脂质和类脂分子(10.83%)和有机氧化合物(8.51%)等。相关性分析揭示了鹅掌楸属花瓣中不同代谢产物之间的联系。其中,201,062对次生代谢物对具有显著相关性(|r|>0.8,p<0.001),其中136,491对呈现正相关性(r>0.8,p<0.01),64,571呈现负相关性(r<-0.8,p<0.001)。通过相关系数构建相关网络,进一步分析差异代谢物对之间的协同调节关系发现。落叶松醇4- o -葡萄糖苷与其它化合物的相关性最高,与101个化合物呈正相关,与144个化合物负相关。青藤碱和5-甲氧基色氨酸紧随其后,分别与511个和124个化合物呈显著相关。其中,木脂素、新木脂素及其相关化合物、有机杂环化合物、生物碱及其衍生物、有机酸及其衍生物、有机氧化合物所占比例较高(50%)。结果表明,这些代谢物可能在鹅掌楸花瓣中发挥重要的合成代谢与催化作用。

图1. 鹅掌楸属花瓣非靶向代谢组样品质量控制与统计分析

图2. 鹅掌楸属花瓣不同代谢产物的相关性分析

通过对鹅掌楸属花瓣差异性积累的次生代谢物富集通路进行分析发现,多个数据集中富集了“类黄酮生物合成”、“类异黄酮生物合成”、“黄酮和黄酮醇生物合成”和“苯丙氨酸生物合成”等代谢通路。在苯丙氨酸和类黄酮生物合成等相关途径中,发现苯丙氨酸、肉桂醛、绿原酸、咖啡酸、杨梅素、樱桃苷、花旗松素、槲皮素、芦丁等多种次生代谢物不同种花瓣中具有不同程度的差异性积累。其中绿原酸在鹅掌楸花瓣呈现较高水平的积累。

图3. 不同比较组合间差异代谢物分析


图4. 鹅掌楸属花瓣苯丙酸合成代谢途径以及差异代谢物积累


为了进一步确定差异苯丙烷代谢物在鹅掌楸花瓣中合成的机制,我们结合对应花瓣RNA-seq数据对该途径中的转录本表达水平进行分析,发现CYP98A成员可能参与鹅掌楸花瓣中对香豆酰亚胺的3′-羟基化和对香豆酰基奎宁酸的羟基化而生成绿原酸。

图5. 鹅掌楸花瓣中苯丙素生物合成途径转录物的差异表达谱


图6. 苯丙素生物合成途径转录本差异表达水平的实时荧光定量PCR验证


基于鹅掌楸基因组与转录组数据对CYP98A亚家族成员进行分析发现,在鹅掌楸中存在8个CYP98A同源蛋白。有趣的是,在多个单子叶、双子叶和基础被子植物中只发现了1-3个CYP98A成员,这表明CYP98A在鹅掌楸进化过程中存在显著的扩张事件,串联重复事件和片段重复分析表明LcCYP98A家族的扩张是由多种因素引起的。系统进化分析将LcCYP98A分为两组,分别属于为单子叶和双子叶。这些结果表明,LcCYP98A家族在进化过程中由于某种特殊的原因在选择过程中被扩张和保存,并可能在鹅掌楸演化过程中发挥着重要的作用。

图7. 鹅掌楸CYP98A基因家族的进化分析

图8. 鹅掌楸属花瓣中绿原酸合成通路图


该研究成果由南京林业大学林木细胞工程课题组完成,博士生胡凌峰为该论文的第一作者,陈金慧教授和郝兆东讲师为通讯作者。

编辑:胡凌峰、郝兆东


Reference:

Linfeng Hu, Long Yu, Yuhao Weng, Haoxian Qu, Dingjie Yang, Ye Lu, Pengkai Wang, Jisen Shi, Zhaodong Hao, Jinhui Chen. Combined non-targeted metabolomic and transcriptomic analysis explains the biosynthetic pathway and differential accumulation of chlorogenic acid in the Liriodendron petal. Scientia Horticulturae, 2024, 328: 112791. doi: 10.1016/j.scienta.2023.112791

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