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抗生素是当前最重要的临床应用药物之一,具有消灭细菌、控制感染的作用。由于存在抗生素滥用现象,细菌的耐药性增强,甚至出现“超级细菌”,这导致因耐药细菌感染而死亡的病例增多,越来越多的人抗拒使用抗生素。
近日,科技日报记者从浙江工业大学获悉,该校环境学院钱海丰教授团队通过分析土壤、水体、城市建筑以及人体等全球四大主要生境的4572个样本中耐药基因的分布情况,建立了抗生素耐药基因风险评估新框架,并给出了详细的耐药基因风险值清单,强调不同的耐药基因风险也有差异。该团队对高风险值的耐药基因制定了快速检测手段、监管机制,可有效减少抗生素耐药及“超级细菌”的出现。相关研究成果近日发表于《自然·通讯》杂志上。
多维度评估耐药基因
“过去大家只知道耐药基因对人类健康有影响,但不清楚它到底有何风险、又有多大风险,大部分人只是简单地认为耐药基因越多,风险就越高。”钱海丰解释道,目前主流的抗生素耐药基因健康风险评估局限于单一的丰度检测上,缺乏系统的风险评估体系或框架。
“除了耐药基因的丰度,移动性与宿主致病性也是评估抗生素耐药基因对人类健康影响的两大重要指标。”钱海丰解释道,简单来说,若某一耐药基因具备从一个微生物中转移到另一微生物中的能力,且转移到了致病菌体内,那么这一耐药基因就有很高的人类健康风险。
基于抗生素耐药基因的移动性和宿主致病性,该团队从公开数据库中获取了近3万个细菌基因组,定量分析了每个耐药基因的这两大属性。综合多维度的评估指标,并结合抗生素的临床使用数据,该团队建立了评估抗生素耐药基因引发人类健康风险的新框架,并给出了各个耐药基因的风险值清单。
据介绍,这一新框架给出了详细的包含每个耐药基因风险值的清单,可为开发设计相应的检测手段、监管机制与治疗方案提供极大便利。此外,以该清单为依据建立的耐药基因监管名录,还可指导相应政策、指南的制定。
判断耐药基因风险等级
钱海丰介绍,团队以较为全球化的视野判断了耐药基因的风险等级,通过评估不同抗生素耐药基因对人类健康的风险,该框架已具备检测人体内潜在耐药基因的能力。有了这个评估方法当患者细菌感染时,医生就可有针对性地筛选出更有效的抗生素对细菌感染患者进行治疗,提供个性化的用药方案。
“我们的研究结果表明,近25%的耐药基因具有人类健康风险,尤其是能同时耐受青霉素、四环素、沙星类等多种抗生素的基因。” 钱海丰直言,团队的这个评估方法强调耐药基因风险亦有差异,风险管控中应分门别类、区别对待。
“数据的部分缺失和样本的不完整性无可避免,因此我们无法准确预测全球各个环境中耐药基因的风险。希望能够构建一个系统全面的监控网络,实现全球样本的完善监管和公开数据的充分共享。”钱海丰表示,当前耐药基因人类健康风险评估只是揭示了潜在的可能性,将来还需要对基因表达水平进行监测,在转录组信息数据的指导下,更进一步精细化预测其风险值。
文章链接:https://doi.org/10.1038/s41467-022-29283-8
《自然通讯》刊登我校钱海丰教授团队重大突破
全球不同生境中耐药基因分布模式以及耐药基因环境——人体共享模式
耐药基因宿主的分布模式 耐药基因移动性与宿主致病性
耐药基因人类健康风险评估新框架及其验证
结合机器学习精准预测人类活动影响下全球海洋耐药基因风险形势
钱海丰教授(左一)指导学生
钱海丰教授团队