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计算化学实验室
北京生命科学研究所计算化学实验室
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黄牛
研究员
北京生命科学研究所计算化学实验室
南开大学物理系学士,美国马里兰州大学博士,加州大学旧金山分校博后。现任职于北京生命科学研究所/清华生物医学交叉研究院,高级研究员。主要研究方向是发展和应用基于物理学原理的计算化学方法,预测生物大分子和化学小分子之间相互结合自由能,架起基础研究与新药创制之间的桥梁。在国际主流期刊上发表60多篇学术论文,获得或正在申请10项国际新药发明专利。利用计算化学方法成功研发多种首创性新药侯选物,在治疗肥胖及代谢相关疾病以及治疗肠易激综合征等领域已聚焦临床前研究阶段。
研究方向
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受体-配体相互作用的物理学过程非常复杂,目前广泛使用的能量打分函数还存在多个局限性因素,很难保证计算结果的准确性。因此,我们从计算化学方法学出发,发展新的基于物理学原理的虚拟筛选打分方法,系统地改进计算受体和配体结合自由能方法中的局限性因素,包括受体和配体之间的范德华和静电相互作用的精确计算、诱导契合的处理、去溶剂化效应和熵变效应等,在提高计算精度同时兼顾计算效率,架起应用基础研究(计算化学方法)与新药创制(药物化学和分子药理学)之间的桥梁。