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SWI/SNF 染色质重塑器家族产生 Remosomes。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-10-02 , DOI: 10.1038/s41598-019-50572-8 Manu Shubhdarshan Shukla 1, 2, 3 , Sajad Hussain Syed 1, 2, 4 , Ramachandran Boopathi 1, 2 , Elsa Ben Simon 1 , Sunil Nahata 1, 2 , Lorrie Ramos 2 , Defne Dalkara 2 , Cendrine Moskalenko 5 , Andrew Travers 6 , Dimitar Angelov 1 , Stefan Dimitrov 2, 7 , Ali Hamiche 8, 9 , Jan Bednar 2, 10
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-10-02 , DOI: 10.1038/s41598-019-50572-8 Manu Shubhdarshan Shukla 1, 2, 3 , Sajad Hussain Syed 1, 2, 4 , Ramachandran Boopathi 1, 2 , Elsa Ben Simon 1 , Sunil Nahata 1, 2 , Lorrie Ramos 2 , Defne Dalkara 2 , Cendrine Moskalenko 5 , Andrew Travers 6 , Dimitar Angelov 1 , Stefan Dimitrov 2, 7 , Ali Hamiche 8, 9 , Jan Bednar 2, 10
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染色质重塑剂是能够改变组蛋白-DNA 相互作用和动员核小体的复合物。它们的作用机制和重构核小体的构象仍然存在争议。在这项工作中，我们使用高分辨率显微镜结合新型生化方法比较了 SWI/SNF 和 ACF 复合物对核小体重塑产物的类型和结构。我们发现 SWI/SNF 产生大量称为“remosomes”的核小体样亚稳态粒子。限制性内切酶可及性测定、DNase I 足迹和 AFM 实验揭示了这些颗粒内扰动的组蛋白-DNA 相互作用。电子冷冻显微镜显示，remosomes 采用各种不同的结构，具有可变的不规则 DNA 路径，类似于 RSC 重塑中描述的那些。Remosome DNA 对限制酶的可及性也显着增加。我们认为 remosomes 的产生是 SWI/SNF 家族重塑者的一个共同特征。相比之下，属于 ISWI 家族的 ACF 重塑器仅产生重新定位的核小体，并且没有发现与额外 DNA 相关的粒子的证据，或者发现了扰动的 DNA 路径。SWI/SNF 类型的重塑剂产生的再体可能代表了一种涉及需要核小体 DNA 可及性的过程的新机制，例如 DNA 修复或转录调节。仅产生重新定位的核小体，并且没有发现与额外 DNA 相关的粒子的证据，或者发现了扰动的 DNA 路径。SWI/SNF 类型的重塑剂产生的再体可能代表了一种涉及需要核小体 DNA 可及性的过程的新机制，例如 DNA 修复或转录调节。仅产生重新定位的核小体，并且没有发现与额外 DNA 相关的粒子的证据，或者发现了扰动的 DNA 路径。SWI/SNF 类型的重塑剂产生的再体可能代表了一种涉及需要核小体 DNA 可及性的过程的新机制，例如 DNA 修复或转录调节。
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更新日期：2019-10-02
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