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Reassortment of newly emergent clade 2.3.4.4b A(H5N1) highly pathogenic avian influenza A viruses in Bangladesh.
Emerging Microbes & Infections ( IF 8.4 ) Pub Date : 2024-12-09 , DOI: 10.1080/22221751.2024.2432351 Subrata Barman,Jasmine C M Turner,M Kamrul Hasan,Sharmin Akhtar,Trushar Jeevan,John Franks,David Walker,Nabanita Mukherjee,Patrick Seiler,Lisa Kercher,Pamela McKenzie,Robert G Webster,Mohammed M Feeroz,Richard J Webby
Emerging Microbes & Infections ( IF 8.4 ) Pub Date : 2024-12-09 , DOI: 10.1080/22221751.2024.2432351 Subrata Barman,Jasmine C M Turner,M Kamrul Hasan,Sharmin Akhtar,Trushar Jeevan,John Franks,David Walker,Nabanita Mukherjee,Patrick Seiler,Lisa Kercher,Pamela McKenzie,Robert G Webster,Mohammed M Feeroz,Richard J Webby
ABSTRACTAvian influenza active surveillance was conducted in Bangladesh from January 2022 to November 2023 in live-poultry markets (LPMs) and Tanguar Haor wetlands. The predominant viruses circulating in LPMs were low pathogenic avian influenza (LPAI) A(H9N2) and clade 2.3.2.1a highly pathogenic avian influenza (HPAI) A(H5N1) viruses. Non-H9N2 LPAIs were found at Tanguar Haor and at a lower prevalence in LPMs. Starting from June 2023, we detected novel genotypes of clade 2.3.4.4b A(H5N1) viruses from ducks in LPMs. The HA, NA, and M genes of these viruses are related to those of 2020 European clade 2.3.4.4b H5N1 viruses such as A/Eurasian Wigeon/Netherlands/1/2020 (Netherlands/1). However, analyses of the other five gene segments' sequences identified three distinct genotypes (BD-G2, BD-G3, and BD-G4). BD-G2 viruses were closely related to the clade 2.3.4.4b H5N1 viruses that have been detected in Japan and nearby regions since November 2022. BD-G3 viruses were reassortants, with gene segments from other Eurasian LPAI viruses. BD-G4 viruses were similar to BD-G2 viruses, but their NS gene was accrued from contemporary Bangladeshi clade 2.3.2.1a A(H5N1) viruses. The ability of any of the clade 2.3.4.4b viruses to displace the long-entrenched 2.3.2.1a A(H5N1) viruses in Bangladesh is unknown.
中文翻译:
孟加拉国新出现的分支 2.3.4.4b A(H5N1) 高致病性甲型禽流感病毒的重组。
摘要2022 年 1 月至 2023 年 11 月在孟加拉国的活禽市场 (LPM) 和 Tanguar Haor 湿地进行了流感主动监测。在 LPM 中传播的主要病毒是低致病性禽流感 (LPAI) 甲型 (H9N2) 和进化枝 2.3.2.1a 高致病性禽流感 (HPAI) 甲型 (H5N1) 病毒。在 Tanguar Haor 发现了非 H9N2 LPAIs,并且在 LPM 中患病率较低。从 2023 年 6 月开始,我们在 LPM 中从鸭子中检测到了分支 2.3.4.4b A(H5N1) 病毒的新基因型。这些病毒的 HA、NA 和 M 基因与 2020 年欧洲分支 2.3.4.4b H5N1 病毒的基因有关,例如 A/Eurasian Wigeon/Netherlands/1/2020 (Netherlands/1)。然而,对其他 5 个基因片段序列的分析确定了三种不同的基因型 (BD-G2、BD-G3 和 BD-G4)。BD-G2 病毒与 2022 年 11 月以来在日本及附近地区检测到的 2.3.4.4b H5N1 病毒分支密切相关。BD-G3 病毒是重排病毒,具有来自其他欧亚 LPAI 病毒的基因片段。BD-G4 病毒与 BD-G2 病毒相似,但它们的 NS 基因是从当代孟加拉国分支 2.3.2.1a A(H5N1) 病毒中积累而来的。在孟加拉国,任何分支 2.3.4.4b 病毒取代根深蒂固的 2.3.2.1a 甲型 H5N1 病毒的能力尚不清楚。
更新日期:2024-11-25
中文翻译:
孟加拉国新出现的分支 2.3.4.4b A(H5N1) 高致病性甲型禽流感病毒的重组。
摘要2022 年 1 月至 2023 年 11 月在孟加拉国的活禽市场 (LPM) 和 Tanguar Haor 湿地进行了流感主动监测。在 LPM 中传播的主要病毒是低致病性禽流感 (LPAI) 甲型 (H9N2) 和进化枝 2.3.2.1a 高致病性禽流感 (HPAI) 甲型 (H5N1) 病毒。在 Tanguar Haor 发现了非 H9N2 LPAIs,并且在 LPM 中患病率较低。从 2023 年 6 月开始,我们在 LPM 中从鸭子中检测到了分支 2.3.4.4b A(H5N1) 病毒的新基因型。这些病毒的 HA、NA 和 M 基因与 2020 年欧洲分支 2.3.4.4b H5N1 病毒的基因有关,例如 A/Eurasian Wigeon/Netherlands/1/2020 (Netherlands/1)。然而,对其他 5 个基因片段序列的分析确定了三种不同的基因型 (BD-G2、BD-G3 和 BD-G4)。BD-G2 病毒与 2022 年 11 月以来在日本及附近地区检测到的 2.3.4.4b H5N1 病毒分支密切相关。BD-G3 病毒是重排病毒,具有来自其他欧亚 LPAI 病毒的基因片段。BD-G4 病毒与 BD-G2 病毒相似,但它们的 NS 基因是从当代孟加拉国分支 2.3.2.1a A(H5N1) 病毒中积累而来的。在孟加拉国,任何分支 2.3.4.4b 病毒取代根深蒂固的 2.3.2.1a 甲型 H5N1 病毒的能力尚不清楚。