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药物再利用的深度学习：方法、数据库和应用
Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science ( IF 16.8 ) Pub Date : 2022-02-08 , DOI: 10.1002/wcms.1597 Xiaoqin Pan 1 , Xuan Lin 2, 3 , Dongsheng Cao 4 , Xiangxiang Zeng 1 , Philip S. Yu 5 , Lifang He 6 , Ruth Nussinov 7, 8 , Feixiong Cheng 9, 10, 11
Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science ( IF 16.8 ) Pub Date : 2022-02-08 , DOI: 10.1002/wcms.1597 Xiaoqin Pan 1 , Xuan Lin 2, 3 , Dongsheng Cao 4 , Xiangxiang Zeng 1 , Philip S. Yu 5 , Lifang He 6 , Ruth Nussinov 7, 8 , Feixiong Cheng 9, 10, 11
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药物开发既耗时又昂贵。将现有药物重新用于新疗法是一种有吸引力的解决方案，它可以以降低的实验成本加速药物开发，特别是针对 2019 年冠状病毒病 (COVID-19)，这是一种由严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 引起的传染病。然而，全面获取和有效整合现有知识和生物医学大数据以有效推进深度学习模型对于其他复杂疾病的药物再利用仍然具有挑战性。在这篇综述中，我们介绍了如何利用深度学习方法和工具进行药物再利用的指南。我们首先总结了用于药物再利用的常用生物信息学和药物基因组学数据库。下一个，我们讨论了最近开发的基于序列和基于图的表示方法以及最先进的基于深度学习的方法。最后，我们介绍了药物再利用在抗击 COVID-19 大流行中的应用，并概述了其未来的挑战。
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更新日期：2022-02-08
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