宋露洋
副教授(访问学者)
研究方向
擅长植物附属微生物组分析和相关研究。研究生期间,以水稻根系微生物组为研究方向,在解析宿主植物附属微生物组成的基础上,进一步探究了宿主基因和微生物的互作,为研究农作物微生物组在宿主植物营养吸收、抗病抗逆生长发育提供理论基础
熟悉植物领域基因编辑CRISPR相关技术,为精准设计和创造全新作物提供了新的策略
擅长植物附属微生物16S/ITS扩增子文库制备以及16S、宏基因组和RNA-seq数据分析,具备从已发表微生物组大数据中分析和挖掘相关信息的数据分析能力
具备微生物学相关实验技能。熟练掌握微生物高通量分离培养鉴定、根系微生物组研究中的合成群落还原法(SynCom)、微生物与分子植物互作功能验证
熟练掌握R语言,具备良好的数据分析及挖掘能力
学术成果
2018申请并已授权实用性发明专利一项“一种改进的16S-seq方法及其应用”(专利号:ZL201811443996.8)
2020年发表研究论文“Engineering CRISPR/Cas9 to mitigate abundant host contamination for 16S rRNA gene-based amplicon sequencing”, Microbiome, (JCR和中科院 一区IF 16.837) 独立第一作者(https://doi.org/10.1186/s40168-020-00859-0)
2021年发表论文“Cas-16S-seq:利用CRISPR/Cas9靶向消除16S-seq中高丰度植物序列的方法”, Bio-101: e2003588. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003588, 独立第一作者。