2024年12月09日，西南地区特色林木种质改良与资源综合利用团队（以下简称团队）在第二教学楼B206举行2024-2025学年第13次组会，团队老师及全体研究生参加。
田自能以“Transcriptome profiling of indole-3-butyric acid-induced adventitious root formation in softwood cuttings of walnut”为题，讲述了核桃IAA和IBA转运体、IBA-IAA转化、生长素信号传导和新生根器官发生相关的基因。揭示了IBA处理对核桃扦插转录组动力学和差异基因表达的影响。诱导成熟核桃品种不定根(AR)形成具有挑战性。然而，成熟树木的AR形成可以通过复幼来改善。在插条中，外源吲哚-3-丁酸(IBA)对AR的形成至关重要，其潜在机制尚不清楚。因此，利用转录组测序来研究IBA诱导的AR形成的机制。结果表明，与对照组相比，IBA处理显著提高了内源性吲哚-3-乙酸(IAA)含量，提高了生根率。此外，JrWOX11和JrWOX5在核桃扦插中的共表达网络分析阐明了复杂的遗传相互作用，强调了它们在AR形成中的关键作用。
耿仕丽以“Metabolomics and transcriptomics analysis revealed the response mechanism of alfalfa to combined cold and saline-alkali stress”为题，主要讲述了植物经常会遇到寒冷和盐碱胁迫，在中高纬度地区的盐碱土壤中，寒冷和盐碱胁迫往往同时发生，从而制约了饲料作物的分布和产量。紫花苜蓿（Medicago sativa L.）是世界上最重要的牧草之一。在本研究中，研究者利用多组学分析了两种紫花苜蓿（肇东[ZD]和蓝月[BM]）对寒冷和盐碱胁迫的复杂响应机制。结果表明，肇东紫花苜蓿比蓝月紫花苜蓿对联合胁迫的耐受能力更强。两个品种的三羧酸循环对联合胁迫做出了积极反应，ZD积累了更多的糖、氨基酸和茉莉酸。两个品种的黄酮生物合成途径的基因表达量和黄酮含量有显著差异。基于RNA-Seq数据的加权基因共表达网络分析和共表达网络分析表明，MsMYB12基因可能通过调控黄酮类化合物的生物合成途径来应对综合胁迫。MsMYB12可直接与MsFLS13的启动子结合并促进其表达。此外，MsFLS13的过表达能提高黄酮醇的积累和抗氧化能力，从而改善对联合胁迫的耐受性。这些发现为提高紫花苜蓿对联合胁迫的抗性提供了新的见解。
姚爱芹以“Broadening the roles of UDP-glycosyltransferases in auxin homeostasis and plant development”为题，该项研究证明了UGT84B1和UGT74D1通过双重IAA和oxIAA糖基化调节植物发育过程中的IAA水平，还发现了一个新的UGT亚家族，其成员冗余介导oxIAA的糖基化并调节黑暗条件下的暗形态形成建成。随着对多个UGT突变体的遗传和生化分析，我们将进一步了解UGTs对IAA稳态和植物发育的贡献。
王何泽以“Expression and function analysis of phenylalanine ammonia-lyase genes involved in Bamboo lignin biosynthesis”为题，讲述了毛竹（Phyllostachys edulis）中的苯丙氨酸解氨酶基因不仅调控木质素生物合成，还参与黄酮类化合物的生物合成。该研究对现有的苯丙氨酸解氨酶基因进行重新分类和整理，分析其基本理化参数；使用已公开发表的转录组数据，评估了PAL基因的表达谱；通过植物基因编辑和瞬时过表达实验，揭示了PAL在木质素生物合成中的作用。为竹子如何实现快速生长和最佳机械强度提供有价值的见解。
华琦利以“Deubiquitination of BES1 by UBP12/UBP13 promotes brassinosteroid signaling and plant growth”为题分享了DUBs UBP12/UBP13拮抗泛素介导的降解以稳定BES1。这两个dub可以调控K46和K63。UBP12/BES1和UBP13/BES1复合物在两者中均有定位细胞质和细胞核。UBP12/13能在离体和植物中去泛素化BES1，且UBP12与无活性的磷酸化BES1和活性去磷酸化BES1相互作用并使其去泛素化体内延迟的BES1降解。在BES1OE植物中，UBP12过表达可显著提高细胞的伸长与BES1OE或UBP12OE相比，叶片长宽比增加。
潘子幸以“The AP2/ERF transcription factor PtoERF15 confers droughttolerance via JA-mediated signaling in Populus”为题，阐释了在杨树中ERF15参与茉莉酸介导的干旱胁迫响应的分子机制。木质部导管在木本植物中起着水分传导中枢的作用，但其在缺水条件下发育和形态发生的潜在机制仍有待阐明。在此，文章鉴定并描述了一个受渗透胁迫诱导的响应因子15（PtoERF15）及其靶标PtoMYC2b，它们参与调控毛白杨在应对干旱时的导管大小、密度以及细胞壁厚度。PtoERF15在杨树茎干正在分化的木质部中优先表达。PtoERF15的过表达有助于维持茎干水势，从而提高耐旱性。转录组和生化分析进一步揭示，PtoERF15直接调控PtoMYC2b，而PtoMYC2b编码茉莉酸（JA）信号通路的一个开关。此外，我们的研究结果证实，来自NAC基因家族的同源基因PtoNAC118/120，作为PtoMYC2b的靶标，参与了杨树导管形态的调控。总体而言，本文的研究为PtoERF15-PtoMYC2b转录级联通过调控木质部导管发育来维持茎干水势，最终提高杨树耐旱性这一过程提供了分子层面的证据。
（王何泽 供稿）