糖尿病肾病(DKD)的发病机制复杂,预后不良,因而探索新的致病因素可能是有益的。尽管控制了血糖,但高血糖的持续存在仍会因代谢记忆而诱发血管并发症。然而,其对DKD的影响仍不清楚。利用GEO数据库中的单细胞RNA测序数据,我们对12种细胞类型进行了聚类,并采用了富集分析和细胞-细胞通讯网络评估。研究发现,DKD进程中的肾间质纤维化与代谢记忆有关。为了进一步鉴定与 DKD 代谢记忆和肾脏纤维化相关的基因,我们将上述人类数据集与大鼠肾脏纤维化模型和小鼠代谢记忆模型相结合。经过重叠,我们筛选出了 NDRG1、NR4A1、KCNC4 和 ZFP36。药理分析和分子对接实验显示,吡格列酮和白藜芦醇可能是影响这些枢纽基因的药物。根据体内外研究结果,我们选择NDRG1作进一步研究。湿实验结果显示:敲除NDRG1可减少HK-2细胞中TGF-β的表达。与糖尿病病程超过10年但未患DKD的患者相比,DKD患者血液样本中NDRG1的表达上调。综上所述,从代谢记忆的角度来看,NDRG1是参与调节DKD患者纤维化的一个关键基因。本课题通过生物信息学分析与实验验证相结合,为识别 DKD 患者的代谢记忆提供了可靠的证据。
目前,该文章被期刊Frontiers in Pharmacology(IF=4.40,中科院2区)顺利接收。冯其老师为该文章的共同第一作者。
文章信息:Tongyue Yang, Qi Feng, Mingwei Shao, Mengxing Pan, Feng Guo, Yi Song, Fengjuan Huang, Zhao Linlin, Jiao Wang, Lina Wu, Guijun Qin, Yanyan Zhao*. The role of metabolic memory in diabetic kidney disease: identification of key genes and therapeutic targets. Frontiers in Pharmacology.