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BMC Genomics | 与 SARS-CoV-2 感染相关的眼部 A-to-I RNA 编辑特征
发布时间:2024-05-18

我们近期在BMC Genomics上发表了题为《Ocular A-to-I RNA editing signatures associated with SARS-CoV-2 infection》的论文 。我们在这篇文章中探讨了新型冠状病毒感染期间眼部腺苷到鸟苷(A-to-I)RNA编辑的变化情况。研究通过分析5种眼部组织(结膜、角膜周缘、角膜、巩膜和视网膜器官)的转录组数据,发现新冠感染显著改变了各种眼部组织的RNA编辑谱。主要结果包括:

眼部RNA编辑水平的整体变化,其中结膜、角膜周缘和巩膜的编辑水平下降,角膜上升,视网膜器官无显著变化;

涉及到脱泛素依赖性蛋白分解过程、转录调节和RNA剪接等功能的差异性RNA编辑(DRE)基因;

DREMAVSMDM2基因中的共同变化,以及在LAMP2基因中跨多种组织的变化;

针对视网膜器官的动态分析发现,新冠感染24小时和96小时的DRE存在明显差异。


论文链接:

Jin, YY., Liang, YP., Huang, WH. et al. Ocular A-to-I RNA editing signatures associated with SARS-CoV-2 infection. BMC Genomics 25, 431 (2024). https://doi.org/10.1186/s12864-024-10324-z