86550
当前位置: 首页   >  课题组新闻   >  复旦大学乔亮教授、河南大学张宇教授来课题进组行学术交流
复旦大学乔亮教授、河南大学张宇教授来课题进组行学术交流
发布时间:2020-12-05

    2020年11月26日,复旦大学乔亮教授和河南大学张宇教授应课题组邀请来武汉大学高等研究院进行学术交流。乔亮教授给高研院及校内师生做了“深度学习用于蛋白质组学数据分析”的报告,介绍了他们DeepDIA方面的最新研究成果,他们设计了基于卷积神经网络和循环神经网络的深度神经网络模型来预测肽段的二级质谱图(MS/MS)和归一化保留时间(iRT),由DDA鉴定得到的肽段列表生成DIA分析所需的谱图库,研究成果发表在《Nature Communications》上。该模型以肽序列为输入,并在每个可能的裂解位点包括氨或水的中性损失以及肽段的iRT输出b/y产物离子的相对强度。在HeLa细胞数据集上将DeepDIA与Prosit进行了比较测试。结果表明,与使用通用模型来生成谱图库相比,使用DeepDIA构建专用于特定仪器的模型预测生成的谱图库质量更好,DIA数据分析检测到的肽段和蛋白数量更多,重复性更好,效果接近DDA构建的谱图库。随后,河南大学棉花国家重点实验室的张宇教授做了题为“利用质谱成像技术进行生物活性分子的筛选”的报告,介绍他们利用质谱技术进行植物科学研究的最新成果。

报告人简介:

    乔亮,博士,复旦大学化学系研究员,博士生导师。2013年毕业于瑞士洛桑联邦理工大学,获博士学位,本科和硕士就读于复旦大学。2015年入选国家海外人才计划,2020年获批国家基金委优秀青年科学基金项目。以第一或通讯作者在Nature Communications、Chem、JACS、Angew. Chem. Int. Ed.、Anal. Chem.等权威期刊上发表论文41篇,还参与发表论文55篇,论文共计被引用1700余次。申报及获得国际、国内发明专利11项。在国内外重要学术会议上做邀请报告20次。承担国家和省部级科研项目9项,作为高级研究人员参与国家和省部级科研项目4项。现任中国蛋白质组学会理事、全国实验医学青年专家委员会委员、全国卫生产业企业管理协会实验医学(质谱分析)专家委员会委员、《高等学校化学学报》青年执行编委、《分析测试学报》青年编委等。研究领域主要包括蛋白质组学、微生物质谱分析、微流控质谱联用技术等

    张宇,博士,河南大学棉花国家重点实验室副教授。2004年本科毕业于辽宁大学。2007年—2012年在日本名古屋工业大学攻读硕士、博士学位。2012年至今在河南大学棉花国家重点实验室负责质谱成像技术平台。主要研究工作是将物理和化学的方法应用到质谱分析中,解决生物学中的科学问题。包括以质谱成像技术为手段的代谢组学方法开发和应用,以及新型荧光探针的开发与应用研究。主审翻译《质谱分析实验指南》一书。在包括J. Bio. Chem.,Mol. Plant. J. Phys. Chem. Lett.等杂志发表文章25篇。