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STAR protocols:王传超课题组发布古人基因组实验和数据分析方案
发布时间:2024-05-06

       古DNA研究是以分子生物学技术为基础发展起来的一个跨学科领域。自20世纪80年代开始古DNA研究以来,研究者们一直在为探索古DNA实验技术和建立古DNA研究标准而努力。随着分子克隆、PCR、二代测序技术、引物延伸捕获和液相杂交捕获等扩增和测序技术的不断涌现,古DNA研究已逐渐成为一个用途广泛、极有发展前景的领域。目前,国内的古DNA研究取得了突破性进展,但也有诸多问题亟待解决,比如古人遗骸和动植物遗物保存情况较差,如何有效地提取和富集古DNA是国内研究的难点,亟需制定和发布关于生物遗存DNA采样和实验室操作的技术细节,提升实验室分析和测试的技术水平,完善相关古DNA研究的学科体系。


       4月30日,王传超课题组在STAR protocols上发表题为“Protocol for a comprehensive pipeline to study ancient human genomes”的论文,发布了古人基因组实验和数据分析的全套流程方案,详尽写出了如何从人类遗骸中提取DNA、构建文库、杂交捕获、定量和测序等实验细节步骤,全面介绍了古人基因组数据质控和群体遗传分析流程等,论文还为古DNA实验和数据分析中可能遇到的问题提出了解决方案,为开展古人DNA实验和数据分析提供详细参考。


       

       厦门大学生命科学学院博士生朱孔阳、何海峰、陶乐为论文共同第一作者,社会与人类学院博士后郭建新(现为中科院昆明动物所助理研究员)和王传超教授为共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金面上项目、福建省杰出青年基金和国家社科基金重大项目经费支持。

       

       全文链接:Protocol for a comprehensive pipeline to study ancient human genomes - ScienceDirect