专刊简介Scope:
解剖结构现代人于五万年前走出非洲,相继定居于欧亚大陆、太平洋地区及美洲大陆。人类群体全球定居过程中经历了复杂的迁徙混合事件。此外,复杂的自然选择驱动力包括瓶颈效应、突变、人群分离混合以及与古人类的遗传渗入促使人类群体快速适应不同洲际特异性的局部环境。上述复杂的人群迁移和混合历史及自然选择内外动力加快了人群群体的遗传分化,不同地理位置、民族语言相关群体形成了其独特的遗传结构和遗传多样性分布模式及对应的复杂性状与疾病的发生机理。过去三十年间,随着一系列基因分型和新一代测序的逐步发展,人类基因组学研究已经取得众多突破性的研究进展,基因研究从不同的角度已经为人类基因组遗传特征、群体遗传结构及群体基因组遗传多样性分布模式提供了基本框架。众多研究结果揭示人群遗传结构与地理分区和语言分类密切相关,从根本上改变了我们对人类群体历史和文化互动的理解。在人类进化、精准医学和法医鉴定研究的组学时代,人群内部和人群之间的基因变异被广泛研究并将其广泛应用于实践需求。随着大规模基因组数据变得越来越常规,我们力求全面精准地探索并理解人类群体精细遗传结构及其对人类群体疾病健康的影响。
因此,为探索重建精细的人类遗传结构分布图谱,我们发起本次专刊“人群群体遗传结构”。我们征集关于基于线粒体、Y染色体及常染色体重建古今人类群体精细遗传结构的综述、论著及短篇交流。
全基因组变异(SNPs、str、indel和CNVs)
古DNA和计算方法与模型
群体混合和生物适应
精细群体遗传结构重建
单亲遗传遗传标记(y染色体和线粒体DNA)
共享等位基因和单倍型模式
其他相关主题
Anatomically modern humans migrated out of Africa around 50,000 years ago. In the subsequent peopling of Eurasia, Oceania, and America, human populations underwent complex evolutionary events, mainly including population bottleneck, mutation, initial genetic isolation and the resulting admixture with incoming populations, and the adaptation of extreme environment introgressed with archaic hominins. This complex migration and admixture history contributed to the formation of the genetic structure of ethnolinguistically diverse populations. With the advent of an array of genotyping and next-generation sequencing, genetic studies have provided the basal framework of the genetic landscape of worldwide populations from different perspectives in the past three decades. The population genetic structure correlates well with geography and language, radically changing our understanding of human population history and cultural interactions. The genetic variations within and between populations are also widely used in the eras of human evolution, precision medicine, and forensic identification. As large-scale genomic data become more routine, we move towards an integrated comprehensive understanding of human populations. We propose this Special Issue to highlight research on the "Genetic Structure of Human Populations". We call for high-quality review articles, original papers, and short communications with a focus on the fine-scale reconstruction of population genetic structure via mitochondrial DNA, Y-chromosome, and autosomal variations of both modern and ancient humans. •genome-wide variations (SNPs, STRs, InDels and CNVs)
•ancient DNA and computation techniques
•population admixture and biological adaptation
•fine-scale population structure reconstruction
•uniparentally inherited genetic markers (Y-chromosomes and Mitochondrial DNA)
•patterns of sharing alleles and haplotypes
专刊截稿时间:2022年11月5日
https://www.mdpi.com/journal/genes/special_issues/human_populations_genetic
客座编辑
王传超,1987年8月生,厦门大学人类学研究所教授、博士生导师、所长,厦门大学生命科学学院、社会与人类学院双聘教授,教育部“长江学者奖励计划”青年学者(2021),国家社科基金重大项目首席专家,厦门大学南强青年拔尖人才支持计划A类人才。2010年本科毕业于中国海洋大学海洋生命学院国家生命科学人才培养基地班,2015年6月获复旦大学现代人类学教育部重点实验室人类生物学博士学位,2015年7月至2017年8月先后任哈佛医学院遗传学系博士后、德国马普人类历史科学研究所博士后,2017年8月入职厦门大学任副教授,2018年6月晋升为教授,2018年11月被遴选为人类学专业博士生导师,2019年11月起兼任厦门大学生命科学学院生物学专业硕士生和博士生导师,2021年9月起任厦门大学生命科学学院双聘教授。近年来,以第一作者或通讯作者在包括Nature、Science、Nature Communications、Current Biology等在内的国内外期刊上发表SCI、SSCI或A&HCI论文40余篇,以参与作者在Cell、Nature Ecology & Evolution、Nature Communications上发表论文6篇,精细解析了东亚人群遗传结构,系统性地重构了东亚人群形成史,为汉藏同源、南岛与壮侗同源提供古基因组学证据,反驳了现代语言起源非洲说以及泛欧亚语的农业传播假说,发展了印欧语的起源和扩散假说,推动了人类基因组学大数据在法医学中的应用,累计被引用2300余次,h指数为24,i10指数为49。主持国家社科基金重大项目等科研项目,经费累计达400余万元,担任SCI期刊Historical Biology副编,SSCI期刊Human Biology副编,SCI期刊Frontiers in Genetics副编、SCI期刊Scientific Reports、PLoS One、Mitochondrial DNA、Annals of Human Biology、Annals of Human Genetics编委, Journal of Forensic Science and Medicine编委、《人类学学报》编委等,研究成果由中央电视台新闻联播、中央电视台新闻频道、《探索发现》等全国多家知名媒体广泛报道。
何光林,厦门大学特任副研究员,厦门大学人类学研究所、生物科学学院生物学和南洋理工大学人文学院博士后。主要从事研究方向:1,个人识别、亲子鉴定、命案现场生物检材溯源相关的法医遗传学检测方法及体系的开发与运用探索;2,基于全基因组变异及测序技术探索法医系谱学新技术在东亚人群中的运用研究,开发无关个体家族谱系智能推断及数据库建设的新方法;3,基于群体基因组学和古基因组学技术重建东亚古今族群遗传演化历史, 解析人类极端环境适应性机制,探索多组学视野下的法医学新运用。先后以第一作者或通讯作者发表SCI论文50余篇,包括法医学顶级期刊Forensic Sci Int Genet(7篇)和International Journal of Legal Medicine (9篇)。此外,在J Syst Evol(5篇,中科院1区Top期刊,其中封面论文1篇)、Eur J Hum Genet(1篇)、Electrophoresis(封面论文1篇)、Front Genet(7篇)、American Journal of Physical Anthropology(1篇)等杂志也发表多篇论著。H指数:17。I10指数:38。ResearchGate score: 36.38。研究内容被引用次数900余次。学术活动: 现担任Frontiers in Genetics,Frontiers in Ecology and Evolution杂志副主编,Instant journal of Forensic Science 杂志编委。